Proteína disulfuro-isomerasa - Protein disulfide-isomerase

Proteína disulfuro-isomerasa
Imagen estructural de la proteína disulfuro isomerasa humana (PDB 1BJX)
Identificadores
Símbolo	?
InterPro	IPR005792

La proteína disulfuro isomerasa, o PDI, es una enzima en el retículo endoplásmico (RE) en eucariotas y el periplasma de bacterias que cataliza la formación y rotura de enlaces disulfuro entre residuos de cisteína dentro de proteínas a medida que se pliegan. Esto permite que las proteínas encuentren rápidamente la disposición correcta de los enlaces disulfuro en su estado completamente plegado y, por lo tanto, la enzima actúa para catalizar el plegamiento de las proteínas .

Estructura

La proteína disulfuro-isomerasa tiene dos dominios catalíticos similares a tiorredoxina (sitios activos), cada uno de los cuales contiene el motivo CGHC canónico y dos dominios no catalíticos. Esta estructura es similar a la estructura de las enzimas responsables del plegamiento oxidativo en el espacio intermembrana de las mitocondrias; un ejemplo de esto es la importación y ensamblaje de IMS mitocondrial (Mia40), que tiene 2 dominios catalíticos que contienen un CX ₉ C, que es similar al dominio CGHC de PDI. La DsbA bacteriana , responsable del plegamiento oxidativo, también tiene un dominio CXXC de tiorredoxina.

Estructura primaria de la proteína disulfuro isomerasa con secuencia de dominios

Función

Plegado de proteínas

PDI muestra propiedades oxidorreductasa e isomerasa , las cuales dependen del tipo de sustrato que se une a la proteína disulfuro-isomerasa y cambios en el estado redox de la proteína disulfuro-isomerasa. Este tipo de actividades permiten el plegamiento oxidativo de proteínas. El plegamiento oxidativo implica la oxidación de residuos de cisteína reducidos de proteínas nacientes; tras la oxidación de estos residuos de cisteína, se forman puentes disulfuro, lo que estabiliza las proteínas y permite estructuras nativas (es decir, estructuras terciarias y cuaternarias).

Mecanismo y vía de plegado oxidativo regular

PDI es específicamente responsable del plegamiento de proteínas en el RE. En una proteína desplegada, un residuo de cisteína forma un disulfuro mixto con un residuo de cisteína en un sitio activo (motivo CGHC) de la proteína disulfuro-isomerasa. Un segundo residuo de cisteína forma entonces un puente disulfuro estable dentro del sustrato , dejando los dos residuos de cisteína del sitio activo de la proteína disulfuro-isomerasa en un estado reducido.

Posteriormente, PDI se puede regenerar a su forma oxidada en el retículo endoplásmico mediante la transferencia de electrones a proteínas reoxidantes como ER oxidorreductina 1 (Ero 1), VKOR (vitamina K epóxido reductasa), glutatión peroxidasa (Gpx7 / 8) y PrxIV (peroxiredoxina IV). ). Se cree que Ero1 es la principal proteína reoxidante de PDI, y la vía de reoxidación de PDI para Ero1 es más conocida que la de otras proteínas. Ero1 acepta electrones de PDI y los dona a moléculas de oxígeno en el RE, lo que conduce a la formación de peróxido de hidrógeno.

Mecanismo proteico mal plegado

La forma reducida (ditiol) de la proteína disulfuro-isomerasa es capaz de catalizar una reducción de un puente disulfuro deformado de un sustrato a través de la actividad reductasa o la actividad isomerasa. Para el método de la reductasa, un enlace disulfuro de sustrato mal plegado se convierte en un par de residuos de cisteína reducidos mediante la transferencia de electrones del glutatión y NADPH. Posteriormente, se produce un plegamiento normal con la formación de un enlace disulfuro oxidativo entre los pares correctos de residuos de cisteína del sustrato, lo que conduce a una proteína plegada correctamente. Para el método de la isomerasa, la transposición intramolecular de los grupos funcionales del sustrato se cataliza cerca del extremo N de cada sitio activo. Por tanto, la proteína disulfuro-isomerasa es capaz de catalizar el intercambio de disulfuro de modificación postraduccional .

Señalización redox

En los cloroplastos del alga unicelular Chlamydomonas reinhardtii, la proteína disulfuro-isomerasa RB60 sirve como un componente sensor redox de un complejo de proteína de unión a ARN m implicado en la fotorregulación de la traducción de psbA, el ARN que codifica la proteína del núcleo del fotosistema II D1. También se ha sugerido que la proteína disulfuro-isomerasa desempeña un papel en la formación de enlaces disulfuro reguladores en los cloroplastos.

Otras funciones

Sistema inmune

Proteína disulfuro isomerasa ayuda de carga péptidos antigénicos en MHC de clase I moléculas. Estas moléculas (MHC I) están relacionadas con la presentación de péptidos por las células presentadoras de antígenos en la respuesta inmune .

Se ha encontrado que la proteína disulfuro-isomerasa está involucrada en la ruptura de enlaces en la proteína gp120 del VIH durante la infección por VIH de células CD4 positivas, y es necesaria para la infección por VIH de linfocitos y monocitos. Algunos estudios han demostrado que está disponible para la infección por VIH en la superficie de la célula agrupada alrededor de la proteína CD4. Sin embargo, estudios contradictorios han demostrado que no está disponible en la superficie celular, sino que se encuentra en cantidades significativas en el plasma sanguíneo.

Actividad de acompañante

Otra función importante de la proteína disulfuro-isomerasa se relaciona con su actividad como acompañante ; su dominio b 'ayuda a la unión de la proteína mal plegada para su posterior degradación . Esto está regulado por tres proteínas de la membrana del RE, la proteína quinasa del retículo endoplásmico quinasa similar al ARN (PERK), la quinasa 1 que requiere inositol (IRE1) y el factor de transcripción activador 6 (ATF6). Responden a altos niveles de proteínas mal plegadas en el RE a través de cascadas de señalización intracelular que pueden activar la actividad de chaperona de PDI. Estas señales también pueden inactivar la traducción de estas proteínas mal plegadas, porque la cascada viaja desde el RE hasta el núcleo.

Ensayos de actividad

Ensayo de turbidez de la insulina : la proteína disulfuro-isomerasa rompe los dos enlaces disulfuro entre dos cadenas de insulina (ayb), lo que da como resultado la precipitación de la cadena b. Esta precipitación se puede controlar a 650 nm, que se usa indirectamente para controlar la actividad de la proteína disulfuro-isomerasa. La sensibilidad de este ensayo está en el rango micromolar.

Ensayo ScRNasa : la proteína disulfuro-isomerasa convierte la ARNasa codificada (inactiva) en ARNasa nativa (activa) que actúa sobre su sustrato. La sensibilidad está en rango micromolar.

Ensayo Di-E-GSSG : este es el ensayo fluorométrico que puede detectar cantidades picomolares de proteína disulfuro-isomerasa y, por lo tanto, es el ensayo más sensible hasta la fecha para detectar la actividad de proteína disulfuro-isomerasa. Di-E-GSSG tiene dos moléculas de eosina unidas al glutatión oxidado (GSSG). La proximidad de las moléculas de eosina conduce a la extinción de su fluorescencia. Sin embargo, tras la rotura del enlace disulfuro por la proteína disulfuro-isomerasa, la fluorescencia aumenta 70 veces.

Estrés e inhibición

Efectos del estrés nitrosativo

La desregulación redox conduce a un aumento del estrés nitrosativo en el retículo endoplásmico. Tales cambios adversos en el entorno celular normal de las células susceptibles, como las neuronas, conducen a enzimas que contienen tiol que no funcionan. Más específicamente, la proteína disulfuro-isomerasa ya no puede reparar proteínas mal plegadas una vez que su grupo tiol en su sitio activo tiene un grupo de monóxido nítrico unido a él; como resultado, se produce una acumulación de proteínas mal plegadas en las neuronas, lo que se ha asociado con el desarrollo de enfermedades neurodegenerativas como la enfermedad de Alzheimer y la enfermedad de Parkinson.

Inhibición

Debido al papel de la proteína disulfuro-isomerasa en varios estados patológicos, se han desarrollado inhibidores de moléculas pequeñas de la proteína disulfuro-isomerasa. Estas moléculas pueden dirigirse al sitio activo de la proteína disulfuro-isomerasa de forma irreversible o reversible.

Se ha demostrado que la actividad de la proteína disulfuro-isomerasa es inhibida por el vino tinto y el jugo de uva, lo que podría ser la explicación de la paradoja francesa .

Miembros

Los genes humanos que codifican las proteínas disulfuro isomerasas incluyen:

Referencias

enlaces externos

• Proteína disulfuro-isomerasa en los encabezados de temas médicos (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .