Número de comisión de enzimas - Enzyme Commission number

El número de la Comisión de Enzimas ( número CE ) es un esquema de clasificación numérico para las enzimas , basado en las reacciones químicas que catalizan . Como sistema de nomenclatura enzimática , cada número EC está asociado con un nombre recomendado para la correspondiente reacción catalizada por enzima.

Los números de CE no especifican enzimas sino reacciones catalizadas por enzimas. Si diferentes enzimas (por ejemplo, de diferentes organismos) catalizan la misma reacción, reciben el mismo número de CE. Además, a través de la evolución convergente , pliegues de proteínas completamente diferentes pueden catalizar una reacción idéntica (a veces se denominan enzimas isofuncionales no homólogas ) y, por lo tanto, se les asignaría el mismo número de CE. Por el contrario, los identificadores UniProt especifican de forma única una proteína por su secuencia de aminoácidos.

Formato de número

Cada código de enzima consta de las letras "EC" seguidas de cuatro números separados por puntos. Esos números representan una clasificación progresivamente más fina de la enzima. Los números EC preliminares existen y tienen una 'n' como parte del cuarto dígito (de serie) (por ejemplo, EC 3.5.1.n3).

Por ejemplo, las aminopeptidasas tripéptidas tienen el código "EC 3.4.11.4", cuyos componentes indican los siguientes grupos de enzimas:

Códigos de nivel superior

Números de CE de nivel superior
Clase Reacción catalizada Reacción típica Ejemplo (s) de enzima con nombre trivial
EC 1
Oxidorreductasas

Reacciones de oxidación / reducción; transferencia de átomos o electrones de H y O de una sustancia a otra

AH + B → A + BH ( reducido )
A + O → AO ( oxidado )
Deshidrogenasa , oxidasa
EC 2
Transferasas
Transferencia de un grupo funcional de una sustancia a otra. El grupo puede ser un grupo metilo, acilo, amino o fosfato AB + C → A + BC Transaminasa , quinasa
EC 3
hidrolasas
Formación de dos productos a partir de un sustrato por hidrólisis. AB + H 2 O → AOH + BH Lipasa , amilasa , peptidasa , fosfatasa
EC 4
Lyases
Adición o eliminación no hidrolítica de grupos de sustratos. Los enlaces CC, CN, CO o CS se pueden escindir RCOCOOH → RCOH + CO 2 o [X-A + BY] → [A = B + XY] Descarboxilasa
EC 5
isomerasas
Reordenamiento intramolécula, es decir, cambios de isomerización dentro de una sola molécula ABC → BCA Isomerasa , mutasa
Ligasas EC 6
Unir dos moléculas mediante la síntesis de nuevos enlaces CO, CS, CN o CC con descomposición simultánea de ATP X + Y + ATP → XY + ADP + P i Sintetasa
EC 7
Translocases
Catalizar el movimiento de iones o moléculas a través de las membranas o su separación dentro de las membranas. Transportador

Similitud de reacción

La similitud entre las reacciones enzimáticas se puede calcular utilizando cambios de enlace, centros de reacción o métricas de subestructura (antes EC-BLAST], ahora EMBL-EBI Enzyme Portal).

Historia

Antes del desarrollo del sistema de números EC, las enzimas se nombraban de manera arbitraria, y nombres como la vieja enzima amarilla y la enzima málica que dan poca o ninguna pista sobre qué reacción se catalizó eran de uso común. La mayoría de estos nombres han caído en desuso, aunque todavía se utilizan unas pocas, especialmente las enzimas proteolíticas con muy baja especificidad, como la pepsina y la papaína , ya que la clasificación racional basada en la especificidad ha sido muy difícil.

En la década de 1950, el caos se estaba volviendo intolerable, y después de que Hoffman-Ostenhof y Dixon y Webb propusieran esquemas algo similares para clasificar las reacciones catalizadas por enzimas, el Congreso Internacional de Bioquímica en Bruselas estableció la Comisión de Enzimas bajo la presidencia de Malcolm Dixon en 1955. La primera versión se publicó en 1961, y la Comisión de Enzimas se disolvió en ese momento, aunque su nombre sigue vivo en el término Número CE . La sexta edición actual, publicada por la Unión Internacional de Bioquímica y Biología Molecular en 1992 como la última versión publicada como libro impreso, contiene 3196 enzimas diferentes. Los suplementos 1-4 se publicaron en 1993-1999. Los suplementos posteriores se han publicado electrónicamente en el sitio web del Comité de Nomenclatura de la Unión Internacional de Bioquímica y Biología Molecular. En agosto de 2018, la IUBMB modificó el sistema agregando la categoría EC 7 de nivel superior que contiene translocases.

Ver también

Referencias

enlaces externos