ABL (gen) - ABL (gene)

ABL1
Estructuras disponibles
PDB	Búsqueda de ortólogos: PDBe RCSB
Lista de códigos de identificación de PDB
	1AB2 , 1AWO , 1BBZ , 1JU5 , 1OPL , 1ZZP , 2ABL , 2E2B , 2FO0 , 2G1T , 2G2F , 2G2H , 2G2I , 2GQG , 2HIW , 2HYY , 2HZ0 , 2HZ4 , 2HZI , 2V7A , 3CS9 , 3EG0 , 3EG1 , 3EG2 , 3EG3 , 3EGU , 3K2M , 3QRI , 3QRJ , 3QRK , 3T04 , 3UE4 , 3UYO , 3PYY , 4J9B , 4J9C , 4J9D , 4J9E , 4J9F , 4J9G , 4J9H , 4J9I , 4JJB , 4JJC , 4JJD , 4TWP , 4WA9 , 4XEY , 4YC8 , 5DC9 , 5DC4 , 5DC0 , 2O88 , 5HU9
Identificadores
Alias	ABL1 , ABL protooncogén 1, tirosina quinasa no receptora, ABL, JTK7, bcr / abl, c-ABL, c-p150, v-abl, CHDSKM, BCR-ABL, Genes, abl
Identificaciones externas	OMIM : 189980 MGI : 87859 HomoloGene : 3783 GeneCards : ABL1
Número CE	2.7.10.2
Ubicación de genes ( humanos )
Chr.	Cromosoma 9 (humano)
Fin	130,887,675 pb
Ubicación de genes ( ratón )
Chr.	Cromosoma 2 (ratón)
Fin	31,804,227 pb
Patrón de expresión de ARN
	Más datos de expresión de referencia
Ontología de genes
Función molecular	• actina monómero de unión ; • dominio de la proteína de unión específica ; • dominio SH3 de unión ; • actividad quinasa ; • proteína de unión C-terminal ; • receptor de señalización de unión ; • unión a ATP ; • actividad de proteína quinasa ; • actividad nicotinato de nucleótidos adeniltransferasa ; • no atraviesa la membrana actividad de la proteína tirosina quinasa ; • de metal la quelación de iones ; • región rica en prolina de unión ; • unión de magnesio ion ; • actividad de transferasa ; • actina de unión de filamentos ; • GO: proteína de unión 0001948 ; • syntaxin unión ; • proteína quinasa C de unión ; • unión a ADN ; • unión de nucleótidos ; • ion manganeso unión ; • proteína activada por mitógeno cinasa de unión ; • proteína actividad de la tirosina quinasa ; • cuatro vías de unión a ADN de unión ; • de unión a ADN de burbujas ; • fosfotirosina residuo de unión de ; • GO: actividad coactivador 0001105 transcripción ; • neuropilina unión ; • SH2 dominio de unión ; • unión ephrin receptor ; • unión a ADN superenrollado ; • ADN de doble cadena específica de la secuencia vinculante;
Componente celular	• citoplasma ; • citosol ; • membrana nuclear ; • membrana ; • componente extrínseco del lado citoplásmico de la membrana plasmática ; • mitocondria ; • citoesqueleto de actina ; • región perinuclear del citoplasma ; • citoesqueleto ; • núcleo ; • nucleolo ; • nucleoplasma ; • borde de ataque de la célula ; • cuerpo nuclear ; • dendrita ; • complejo que contiene proteínas ; • cuerpo de células neuronales ; • postsinapsis;
Proceso biológico	• regulación positiva de la fosforilación de proteínas ; • homeostasis de las células B-1 B ; • regulación de la extensión del axón ; • proceso neuromuscular que controla el equilibrio ; • regulación positiva de la diferenciación de las células musculares ; • respuesta celular al estímulo de daño del ADN ; • fosforilación de proteínas ; • regulación de la adhesión celular ; • proceso de modificación de proteínas celulares ; • regulación de la polimerización de microtúbulos ; • proteína inducida por daño en el ADN fosforilación ; • intrínseca de apoptosis vía de señalización en respuesta al daño del ADN ; • regulación positiva de ERK1 y ERK2 en cascada ; • la adhesión celular dependiente de sustrato difusión ; • derivado de plaquetas factor de crecimiento vía de señalización de receptor-beta ; • regulación positiva de la unión del filamento de actina ; • Vía de señalización del receptor de células B ; • Proceso apoptótico ; • Regulación negativa del proceso apoptótico de las células endoteliales ; • Morfogénesis del cerebelo ; • Regulación de la reorganización del citoesqueleto de actina ; • Regulación de la transcripción, plantilla de ADN ; • Vía de señalización del receptor del factor de crecimiento epidérmico ; • Fc-gam Vía de señalización del receptor ma involucrada en la fagocitosis ; • Establecimiento de la localización de proteínas ; • Desarrollo del timo ; • Regulación negativa de la actividad de la fosfolipasa C ; • Regulación positiva del ciclo celular mitótico ; • Ramificación del filamento de actina ; • Desarrollo del bazo ; • Respuesta al estrés oxidativo ; • Fagocitosis ; • Regulación positiva de la peptidil-tirosina fosforilación ; • regulación de la respuesta al daño del ADN estímulo ; • mitocondrial despolarización ; • regulación positiva de Wnt vía de señalización, la polaridad celular plana vía ; • derivado de plaquetas receptor del factor de crecimiento vía de señalización ; • regulación de endocitosis ; • activación de la proteína quinasa actividad C ; • regulación de actina organización del citoesqueleto ; • fosforilación ; • transducción de señales en respuesta al daño del ADN ; • regulación positiva de la actividad oxidorreductasa ; • regulación positiva de la liberación del ión calcio secuestrado en el citosol ; • regulación negativa de la señalización de la quinasa I-kappaB / NF-kappaB ; • regulación de la motilidad celular ; • regulación positiva de unión de microtúbulos ; • adhesión celular ; • regulación de la autofagia ; • autofosforilación de peptidil-tirosina ; • diferenciación de células T alfa-beta ; • regulación de la senescencia celular ; • regulación negativa de la actividad de la proteína serina / treonina quinasa ; • organización del citoesqueleto de actina ; • regulación negativa de la senescencia celular ; • regulación positiva de Proliferación de osteoblastos ; • GO: 0007067 ciclo celular mitótico ; • Proliferación de células T activadas ; • Endocitosis ; • Regulación negativa de la adhesión célula-célula ; • Proliferación de células B involucrada en la respuesta inmune ; • Respuesta celular a la dopamina ; • Regulación positiva de la concentración de iones de calcio citosólico ; • Regulación positiva de la neurona muerte ; • regulación del ciclo celular ; • regulación negativa de la vía de señalización de BMP ; • autofagia ; • proliferación de células B ; • regulación negativa de la actividad de ubiquitina-proteína transferasa ; • ensamblaje de microespúas ; • regulación positiva del proceso apoptótico ; • regulación de la organización de la matriz extracelular ; • regulación positiva de I-kappaB familiares señalización ase / NF-kappaB ; • Regulación negativa de la cascada ERK1 y ERK2 ; • Diferenciación de células B de una etapa de transición ; • Reparación de desajustes ; • Diferenciación de células gliales de Bergmann ; • Fosforilación de peptidil-tirosina ; • Brote colateral ; • Respuesta celular al lipopolisacárido ; • Regulación negativa del ciclo celular mitótico ; • respuesta celular al peróxido de hidrógeno ; • Reparación del ADN ; • Respuesta inmune innata ; • Cierre del tubo neural ; • Desarrollo post-embrionario ; • Diferenciación neuronal ; • Respuesta celular al estrés oxidativo ; • Regulación de la proliferación de la población celular ; • Autofosforilación de proteínas ; • Diferenciación de células neuroepiteliales ; • Vía de señalización mediada por integrinas ; • regulación positiva de la migración de las células endoteliales ; • diferenciación celular ; • regulación de la transducción de la señal de la proteína Cdc42 ; • vía de señalización de la neuropilina ; • migración de las células endoteliales ; • regulación de la diferenciación de las células T ; • regulación positiva de la transcripción por la ARN polimerasa II ; • vía de señalización del receptor de las células T ; • positivo r egulación del ensamblaje de fibras de estrés ; • regulación positiva del ensamblaje de adhesión focal ; • cambio de conformación del ADN ; • regulación positiva de la migración celular involucrada en la angiogénesis de brotación ; • regulación positiva de la propagación celular dependiente de la adhesión del sustrato ; • regulación negativa de la potenciación sináptica a largo plazo ; • regulación del tallo hematopoyético diferenciación celular ; • regulación de la modificación de la estructura sináptica ; • regulación positiva de la ramificación de los vasos sanguíneos ; • regulación positiva de la actina reorganización del citoesqueleto;
	Fuentes: Amigo / QuickGO
Ortólogos
	25
	11350
	ENSG00000097007
	ENSMUSG00000026842
	P00519
	P00520
	NM_007313 ; NM_005157
	NM_001112703 ; NM_009594 ; NM_001283045 ; NM_001283046 ; NM_001283047
	NP_005148 ; NP_009297
	NP_001106174 ; NP_001269974 ; NP_001269975 ; NP_001269976 ; NP_033724
	Wikidata
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La tirosina-proteína quinasa ABL1 también conocida como ABL1 es una proteína que, en humanos, está codificada por el gen ABL1 (símbolo anterior ABL ) ubicado en el cromosoma 9 . c-Abl a veces se usa para referirse a la versión del gen que se encuentra dentro del genoma de los mamíferos, mientras que v-Abl se refiere al gen viral, que inicialmente se aisló del virus de la leucemia murina de Abelson .

Función

El protooncogén ABL1 codifica una proteína tirosina quinasa citoplásmica y nuclear que se ha implicado en procesos de diferenciación celular , división celular , adhesión celular y respuesta al estrés, como la reparación del ADN . La actividad de la proteína ABL1 está regulada negativamente por su dominio SH3 y la deleción del dominio SH3 convierte a ABL1 en un oncogén . La translocación t (9; 22) da como resultado la fusión de la cabeza con la cola de los genes BCR y ABL1 , lo que conduce a un gen de fusión presente en muchos casos de leucemia mielógena crónica . La actividad de unión al ADN de la tirosina quinasa ABL1 expresada de forma ubicua está regulada por la fosforilación mediada por CDC2 , lo que sugiere una función del ciclo celular para ABL1. El gen ABL1 se expresa como una transcripción de ARNm de 6 o 7 kb, con primeros exones empalmados alternativamente empalmados con los exones 2-11 comunes.

Significación clínica

Dominio de quinasa ABL1 (azul) en complejo con el inhibidor de tirosina quinasa Bcr-Abl de segunda generación nilotinib (rojo)

Las mutaciones en el gen ABL1 están asociadas con la leucemia mielógena crónica (LMC). En CML, el gen es activado por ser translocado dentro del BCR (breakpoint cluster region) gen en el cromosoma 22. Este nuevo gen de fusión, BCR-ABL , codifica una tirosina quinasa no regulada, citoplasma-dirigida que permite que las células proliferen sin ser regulado por citocinas . Esto, a su vez, permite que la célula se vuelva cancerosa .

Este gen es socio de un gen de fusión con el gen BCR en el cromosoma Filadelfia , una anomalía característica en la leucemia mielógena crónica (LMC) y rara vez en algunas otras formas de leucemia . El transcrito BCR-ABL codifica una tirosina quinasa , que activa mediadores del sistema de regulación del ciclo celular , lo que conduce a un trastorno mieloproliferativo clonal . La proteína BCR-ABL puede ser inhibida por varias moléculas pequeñas. Uno de estos inhibidores es el mesilato de imatinib , que ocupa el dominio tirosina quinasa e inhibe la influencia de BCR-ABL en el ciclo celular . También se están desarrollando inhibidores de la tirosina quinasa BCR-ABL de segunda generación para inhibir mutantes de BCR-ABL resistentes a imatinib.

Interacciones

Se ha demostrado que el gen ABL interactúa con:

ABI1 ,
ABI2 ,
ABL2 ,
ATM ,
BCAR1 ,
BCR ,
BRCA1 ,
CAT ,
CBL ,
CRKL ,
DOK1 ,
EPHB2 ,
GPX1 ,
GRB10 ,
MTOR ,
GRB2 ,
MDM2 ,
NCK1 ,
NEDD9 ,
NTRK1 ,
P73 ,
PAG1 ,
PAK2 ,
PSTPIP1 ,
RAD9A ,
RAD51 ,
RB1 ,
RFX1 ,
RYBP ,
SHC1 ,
SORBS2 ,
SPTA1 ,
SPTAN1 ,
TERF1 ,
VAV1 y
YTHDC1 .

Regulación

Existe alguna evidencia de que la expresión de Abl está regulada por el microARN miR-203 .

Ver también

Gen BCR

Referencias

Otras lecturas

Shore SK, Tantravahi RV, Reddy EP (diciembre de 2002). "Transformar las vías activadas por la tirosina quinasa v-Abl" . Oncogén . 21 (56): 8568–76. doi : 10.1038 / sj.onc.1206084 . PMID 12476303 .
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enlaces externos

Genes, + abl en la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU. Medical Subject Headings (MeSH)
Herencia mendeliana en línea en el hombre (OMIM): 189980 (ABL)
Abelson + Leucemia + Virus en los encabezados de temas médicos (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
Tirosina quinasa de Drosophila Abl - La mosca interactiva
Información ABL1 con enlaces en la puerta de enlace de migración celular
ABL1 en el Atlas de genética y oncología
Ubicación del genoma humano ABL1 y página de detalles del gen ABL1 en UCSC Genome Browser .
Resumen de toda la información estructural disponible en el PDB para UniProt : P00519 (Tirosina-proteína quinasa humana ABL1) en PDBe-KB .
Descripción general de toda la información estructural disponible en el PDB para UniProt : P00520 (Tirosina-proteína quinasa de ratón ABL1) en PDBe-KB .

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