Dominio RhoGEF - RhoGEF domain
| Dominio DH / PH RhoGEF | |||||||||||
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 Estructura del dominio RhoGEF de la proteína Son of sevenless humana, un ejemplo de un dominio RhoGEF DH / PH.
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| Identificadores | |||||||||||
| Símbolo | RhoGEF | ||||||||||
| Pfam | PF00621 | ||||||||||
| InterPro | IPR035899 IPR000219, IPR035899 | ||||||||||
| INTELIGENTE | RhoGEF | ||||||||||
| SCOP2 | 1dbh / SCOPe / SUPFAM | ||||||||||
| Proteína OPM | 1xd4 | ||||||||||
| CDD | cd00160 | ||||||||||
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| Dedicador de citocinesis (DOCK) Dominio RhoGEF | |||||||||||
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| Identificadores | |||||||||||
| Símbolo | RhoGEF | ||||||||||
| Pfam | PF06920 | ||||||||||
| InterPro | IPR010703 IPR026791, IPR010703 | ||||||||||
| SCOP2 | 1wg7 / SCOPe / SUPFAM | ||||||||||
| CDD | cd11684 | ||||||||||
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El dominio RhoGEF describe dos dominios estructurales distintos con actividad del factor de intercambio de nucleótidos de guanina (GEF) para regular las pequeñas GTPasas de la familia Rho . Rho pequeñas GTPasas son inactivas cuando se unen a GDP pero activas cuando se unen a GTP ; Los dominios RhoGEF en proteínas pueden promover la liberación de GDP y la unión de GTP para activar miembros específicos de la familia Rho, incluidos RhoA , Rac1 y Cdc42 .
La clase más grande de RhoGEF se compone de proteínas que contienen el dominio de "homología Dbl " ( DH ), que casi siempre se encuentra junto con un dominio de homología de pleckstrina (PH) para formar una estructura de dominio DH / PH combinada.
Una clase distinta de RhoGEF son las proteínas que contienen el dominio DOCK / CZH / DHR-2 . Esta estructura no tiene similitud de secuencia con los dominios de homología DBL.
Proteínas humanas que contienen dominio DH / PH RhoGEF
ABR ; AKAP13 / ARHGEF13 / Lbc ; ALS2 ; ALS2CL ; ARHGEF1 / p115-RhoGEF ; ARHGEF10 ; ARHGEF10L ; ARHGEF11 / PDZ-RhoGEF. ; ARHGEF12 / LARG ; ARHGEF15 ; ARHGEF16 ; ARHGEF17 ; ARHGEF18 ; ARHGEF19 ; ARHGEF2 ; ARHGEF25 ; ARHGEF26 ; ARHGEF28 ; ARHGEF3 ; ARHGEF33 ; ARHGEF35 ; ARHGEF37 ; ARHGEF38 ; ARHGEF39 ; ARHGEF4 ; ARHGEF40 ; ARHGEF5 ; ARHGEF6 / alpha-PIX ; ARHGEF7 / beta-PIX ; ARHGEF9 ; BCR ; DNMBP ; ECT2 ; ECT2L ; FARP1 ; FARP2 ; FGD1 ; FGD2 ; FGD3 ; FGD4 ; FGD5 ; FGD6 ; ITSN1 / Intersectina 1 ; ITSN2 / Intersectin 2 ; KALRN / Kalirin ; MCF2 ; MCF2L ; MCF2L2 ; NET1 ; NGEF ; OBSCN ; PLEKHG1 ; PLEKHG2 ; PLEKHG3 ; PLEKHG4 ; PLEKHG4B ; PLEKHG5 ; PLEKHG6 ; PREX1 ; PREX2 ; RASGRF1 ; RASGRF2 ; SPATA13 ; TIAM1 ; TIAM2 ; TRIO ; VAV1 ; VAV2 ; VAV3 .
Proteínas humanas que contienen dominio DOCK / CZH RhoGEF
DOCK1 / DOCK180 ; DOCK2 ; DOCK3 / MOCA ; DOCK4 ; DOCK5 ; DOCK6 / ZIR1 ; DOCK7 / ZIR2 ; DOCK8 / ZIR3 ; DOCK9 / Zizimin1 ; DOCK10 / Zizimin2 ; DOCK11 / Zizimin3
Ver también
Referencias
Otras lecturas
- Hart MJ, Eva A, Evans T, Aaronson SA, Cerione RA (noviembre de 1991). "Catálisis del intercambio de nucleótidos de guanina en la proteína CDC42Hs por el producto oncogénico dbl". Naturaleza . 354 (6351): 311–4. doi : 10.1038 / 354311a0 . PMID 1956381 . S2CID 4240053 .
- Tan EC, Leung T, Manser E, Lim L (diciembre de 1993). "El gen relacionado con la región del clúster de punto de ruptura activo humano codifica una proteína cerebral con homología con las proteínas de intercambio de nucleótidos de guanina y las proteínas activadoras de GTPasa" . La Revista de Química Biológica . 268 (36): 27291–8. doi : 10.1016 / S0021-9258 (19) 74248-3 . PMID 8262969 .
- Soisson SM, Nimnual AS, Uy M, Bar-Sagi D, Kuriyan J (octubre de 1998). "Estructura cristalina de los dominios de homología Dbl y pleckstrin de la proteína humana Son of sevenless" . Celular . 95 (2): 259–68. doi : 10.1016 / S0092-8674 (00) 81756-0 . PMID 9790532 . S2CID 11868669 .
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