El 1945-1946 Campeonato Panhelénico fue la temporada número 12 de las más altas de fútbol de la liga de Grecia y la primera después de la 2 ª Guerra Mundial . Los clubes que participaron fueron los campeones de las tres asociaciones de fútbol fundadoras de la HFF : Atenas , El Pireo y Macedonia .
Aris ganó el campeonato por su tercer título. Inicialmente, con la finalización de los 6 partidos, Aris ocupó el primer lugar en la clasificación. Pero luego la HFF aceptó las objeciones de sus oponentes por uso ilegal del jugador Siotis (que jugó en dos clubes en la misma temporada), otorgando 2-0 a su favor, los últimos 3 de sus 4 partidos (un empate a domicilio contra AEK Atenas y triunfos en casa ante Olympiacos y AEK), mientras que al mismo tiempo puso a cero el club de Tesalónica para esos partidos. Durante unos días, el ranking se formó con la declaración del AEK como campeón por parte de la HFF y Aris llevando el tema a su asamblea general. Al final, Aris se reivindicó en la apelación y ganó el título. El sistema de puntos fue: Victoria: 3 puntos - Empate: 2 puntos - Derrota: 1 punto .
una.
^ La clasificación se formó en función de la proporción de goles.
El campeonato se interrumpió cuando el 19 de mayo de 1946 y sin que se cumpliera la jornada 15, mientras que también hubo partidos aplazados y de repetición. La HFF declaró a los campeones de Atenas, El Pireo y Macedonia los primeros clubes de la clasificación en participar en la ronda final del campeonato panhelénico.
una. ^ La clasificación se formó en función de la proporción de goles.
B. ^ Olympiacos y Argonaftis tenían 1 partido menos, pero como se decidió el primer y último lugar, el partido fue cancelado para que el campeonato panhelénico comenzara a tiempo.