Variantes de SARS-CoV-2 - Variants of SARS-CoV-2

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Pandemia de COVID-19
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El síndrome respiratorio agudo severo coronavirus 2 (SARS-CoV-2), el virus que causa la enfermedad por coronavirus 2019 (COVID-19), tiene muchas variantes ; se cree, o se ha creído, que algunos son de particular importancia debido a su potencial para aumentar la transmisibilidad, aumentar la virulencia o reducir la eficacia de las vacunas contra ellos.

Visión general

La aparición de SARS-CoV-2 puede haber resultado de eventos de recombinación entre un coronavirus similar al SARS de murciélago y un coronavirus pangolín a través de la transmisión entre especies.

Los primeros genomas de virus humanos disponibles se obtuvieron de pacientes desde diciembre de 2019, y los investigadores chinos compararon estos genomas tempranos con cepas de coronavirus de murciélago y pangolín para estimar el tipo de coronavirus humano ancestral; el tipo de genoma ancestral identificado se etiquetó como "S", y su tipo derivado dominante se etiquetó como "L" para reflejar los cambios de aminoácidos mutantes. Independientemente, los investigadores occidentales llevaron a cabo análisis similares pero etiquetaron el tipo ancestral "A" y el tipo derivado "B". El tipo B mutó en otros tipos, incluido el B.1, que es el antepasado de las principales variantes mundiales preocupantes, etiquetadas en 2021 por la OMS como alfa, beta, gamma y delta.

Al principio de la pandemia, había pocos virus variantes "mutantes" debido al pequeño número de personas infectadas (es decir, había menos oportunidades para que emergieran mutantes de escape). Con el paso del tiempo, el SARS-CoV-2 comenzó a evolucionar para volverse más transmisible. En particular, la variante Alpha y la variante Delta son más transmisibles que el virus original identificado alrededor de Wuhan en China.

Las variantes preocupantes del SARS-CoV-2 pueden mutar para que puedan continuar propagándose frente al aumento de la inmunidad de la población mientras mantienen su capacidad de replicación.

La siguiente tabla presenta información y el nivel de riesgo relativo para las variantes de interés (VOC). Los intervalos asumen un nivel de confianza o credibilidad del 95% , a menos que se indique lo contrario. Actualmente, todas las estimaciones son aproximaciones debido a la limitada disponibilidad de datos para los estudios. Para Alfa, Beta, Gamma y Delta, no hay cambios en la precisión de la prueba , y algunos anticuerpos monoclonales retienen la actividad de los anticuerpos neutralizantes .

Identificación				Aparición			Cambios en relación con las variantes que circulaban anteriormente en el momento y lugar de aparición.				Actividad de anticuerpos neutralizantes (o eficacia cuando esté disponible)
Etiqueta de la OMS	PANGO linaje	Variante PHE	Nextstrain clado	Primer brote	Muestra más temprana	COV designado	Mutaciones notables	Transmisibilidad	Hospitalización	Mortalidad	De una infección natural	De vacunación
Alfa	B.1.1.7	VOC ‑ 20DEC ‑ 01	20I (V1)	Reino Unido	20 septiembre 2020	18 dic 2020	69–70del, N501Y, P681H	+ 29% ( 24 -33% )	+ 52% (47 -57% )	+ 59% (44 -74% ) CFR 0.06% para el grupo de edad <50, 4.8% para el grupo de edad> 50	Reducción mínima	Reducción mínima
	B.1.1.7 con E484K	VOC ‑ 21FEB ‑ 02			26 de enero de 2021	5 de febrero de 2021	E484K, 69–70del, N501Y, P681H				Considerablemente reducido	Considerablemente reducido
Beta	B.1.351	VOC ‑ 20DEC ‑ 02	20H (V2)	Sudáfrica	Mayo de 2020	14 de enero de 2021	K417N, E484K, N501Y	+ 25% (20 -30% )	Bajo investigación	Posiblemente aumentado	La respuesta reducida de las células T provocada por el virus D614G sigue siendo eficaz	Eficacia: reducida frente a enfermedades sintomáticas, retenida frente a enfermedades graves
Gama	P.1	VOC-21JAN-02	20J (V3)	Brasil	Nov. De 2020	15 de enero de 2021	K417T, E484K, N501Y	+ 38% (29 -48% )	Posiblemente aumentado	+ 50% (50% CrI ,20 -90% )	Reducido	Retenido por muchos
Delta	B.1.617 .2	VOC ‑ 21APR ‑ 02	21A	India	Oct. De 2020	6 de mayo de 2021	L452R, T478K, P681R	+ 97% (76 -117% )	+ 85% (39 -147% ) en relación con Alpha	+ 137% (50 -230% ) CFR 0,04% para el grupo de edad <50 no vacunado, 6,5% para el grupo de edad> 50 no vacunado	Se produjeron reinfecciones, con una tasa de incidencia menor que las infecciones vacunadas	Reducción de la eficacia para enfermedades no graves

  Muy alto riesgo   Alto riesgo   Riesgo medio   Riesgo bajo   Riesgo desconocido

Nomenclatura

Nomenclaturas correspondientes al SARS-CoV-2

Linajes PANGO	Notas a los linajes PANGO	Clados Nextstrain, 2021	GISAID clados	Variantes notables
A.1 – A.6		19B	S	Contiene "secuencia de referencia" WIV04 / 2019
B.3 – B.7 , B.9 , B.10 , B.13 – B.16		19A	L
			O
B.2			V
B.1	B.1.5 – B.1.72	20A	GRAMO	Lineage B.1 en el sistema de nomenclatura de PANGO Lineages; incluye Delta / B.1.617
	B.1.9 , B.1.13 , B.1.22 , B.1.26 , B.1.37		GH
	B.1.3 – B.1.66	20C		Incluye Epsilon / B.1.427 / B.1.429 / CAL.20C y Eta / B.1.525
		20G		Predominante en EE. UU. En general, febrero de 21
		20H		Incluye el linaje Beta / B.1.351 también conocido como 20H / 501Y.V2 o 501.V2
	B.1.1	20B	GRAMO	Incluye B.1.1.207
		20D
		20J		Incluye Gamma / P.1 y Zeta / P.2
		20F
		20I		Incluye Alpha / B.1.1.7 también conocido como VOC-202012/01, VOC-20DEC-01 o 20I / 501Y.V1
	B.1.177	20E (EU1)	GV	Derivado de 20A

Las variantes del SARS-CoV-2 se clasifican de acuerdo con su linaje y las mutaciones de los componentes, sin embargo, a julio de 2021, no se ha establecido una nomenclatura consistente para él. Muchas organizaciones, incluidos gobiernos y medios de comunicación, se refieren coloquialmente a variantes preocupantes según el país en el que se identificaron por primera vez. Después de meses de discusiones, la Organización Mundial de la Salud anunció nombres con letras griegas para cepas importantes el 31 de mayo de 2021, por lo que se podría hacer referencia a ellas fácilmente de una manera simple, fácil de decir y no estigmatizante. Es posible que esta decisión se haya tomado en parte debido a las críticas de los gobiernos sobre el uso de nombres de países para referirse a variantes del virus.

Si bien hay muchos miles de variantes de SARS-CoV-2, los subtipos del virus se pueden clasificar en grupos más grandes, como linajes o clados . Se han propuesto tres nomenclaturas principales, generalmente utilizadas:

• En enero de 2021, GISAID —haciendo referencia al SARS-CoV-2 como hCoV-19— había identificado ocho clados globales (S, O, L, V, G, GH, GR y GV).
• En 2017, Hadfield et al. anunció Nextstrain , destinado "para el seguimiento en tiempo real de la evolución de patógenos". Posteriormente, Nextstrain se utilizó para rastrear el SARS-CoV-2, identificando 13 clados principales (19A-B, 20A-20J y 21A) a partir de junio de 2021.
• En 2020, Rambaut et al. del equipo de software de Asignación Filogenética de Linajes Named Global Outbreak (PANGOLIN) propuso en un artículo "una nomenclatura dinámica para los linajes del SARS-CoV-2 que se centra en los linajes de virus en circulación activa y aquellos que se propagan a nuevas ubicaciones"; en agosto de 2021, se habían designado 1340 linajes.

Cada instituto nacional de salud pública también puede instituir su propio sistema de nomenclatura con el fin de rastrear variantes específicas. Por ejemplo, Public Health England designó cada variante rastreada por año, mes y número en el formato [AAAA] [MM] / [NN], con el prefijo "VUI" o "VOC" para una variante en investigación o una variante de interés, respectivamente. Este sistema ahora ha sido modificado y ahora usa el formato [YY] [MMM] - [NN], donde el mes se escribe usando un código de tres letras.

Secuencia de referencia

Como actualmente no se sabe cuándo ocurrió el caso índice o el 'paciente cero', la elección de la secuencia de referencia para un estudio dado es relativamente arbitraria, con diferentes opciones de estudios de investigación notables que varían de la siguiente manera:

• La primera secuencia, Wuhan-1 , se recopiló el 24 de diciembre de 2019.
• Un grupo (Sudhir Kumar et al.) Se refiere ampliamente a un genoma de referencia NCBI (GenBankID: NC_045512; GISAID ID: EPI_ISL_402125), esta muestra se recolectó el 26 de diciembre de 2019, aunque también utilizaron el genoma de referencia WIV04 GISAID (ID: EPI_ISL_402124) , en sus análisis.
• Según otra fuente (Zhukova et al.), Se cree que la secuencia WIV04 / 2019 , perteneciente al clado GISAID S / linaje PANGO A / clado Nextstrain 19B, refleja más fielmente la secuencia del virus original que infecta a los humanos, conocido como " secuencia cero ". WIV04 / 2019 se tomó una muestra de un paciente sintomático el 30 de diciembre de 2019 y se usa ampliamente (especialmente por aquellos que colaboran con GISAID) como secuencia de referencia .

Los investigadores consideran que la variante muestreada e identificada por primera vez en Wuhan, China, difiere del genoma progenitor en tres mutaciones. Posteriormente, han evolucionado muchos linajes distintos de SARS-CoV-2.

Criterios de notoriedad

Los virus generalmente adquieren mutaciones con el tiempo, dando lugar a nuevas variantes. Cuando una nueva variante parece estar creciendo en una población, puede etiquetarse como una "variante emergente". En el caso del SARS-CoV-2, los nuevos linajes a menudo se diferencian entre sí por solo unos pocos nucleótidos.

Algunas de las posibles consecuencias de las variantes emergentes son las siguientes:

• Mayor transmisibilidad
• Aumento de la morbilidad
• Aumento de la mortalidad
• Capacidad para evadir la detección mediante pruebas de diagnóstico.
• Disminución de la susceptibilidad a los medicamentos antivirales (si dichos medicamentos están disponibles)
• Disminución de la susceptibilidad a los anticuerpos neutralizantes, ya sea terapéuticos (p. Ej., Plasma de convalecencia o anticuerpos monoclonales) o en experimentos de laboratorio.
• Capacidad para evadir la inmunidad natural (p. Ej., Provocar reinfecciones)
• Capacidad para infectar a personas vacunadas.
• Mayor riesgo de afecciones particulares como el síndrome inflamatorio multisistémico o el COVID prolongado .
• Mayor afinidad por grupos demográficos o clínicos particulares, como niños o personas inmunodeprimidas.

Las variantes que parecen cumplir uno o más de estos criterios pueden etiquetarse como "variantes en investigación" o "variantes de interés" en espera de la verificación y validación de estas propiedades. La característica principal de una variante de interés es que muestra evidencia que demuestra que es la causa de una mayor proporción de casos o grupos de brotes únicos; sin embargo, también debe tener una prevalencia limitada o una expansión a nivel nacional, o la clasificación se elevaría a una " variante de preocupación ". Si hay pruebas claras de que la eficacia de las medidas de prevención o intervención para una variante particular se reduce sustancialmente, esa variante se denomina "variante de gran consecuencia".

Variantes de interés (OMS)

A continuación se enumeran las variantes de preocupación (VOC) actualmente reconocidas por la Organización Mundial de la Salud . Otras organizaciones como los CDC en los Estados Unidos a veces han usado una lista ligeramente diferente, pero a partir de julio de 2021 su lista coincide con la de la OMS.

Alfa (linaje B.1.1.7)

Detectado por primera vez en octubre de 2020 durante la pandemia de COVID-19 en el Reino Unido a partir de una muestra tomada el mes anterior en Kent, el linaje B.1.1.7, etiquetado como variante Alpha por la OMS, se conocía anteriormente como la primera variante bajo investigación en diciembre. 2020 (VUI - 202012/01) y posteriormente anotado como VOC-202012/01. También se conoce como 20I (V1), 20I / 501Y.V1 (anteriormente 20B / 501Y.V1) o 501Y.V1. Desde entonces, sus probabilidades de prevalencia se han duplicado cada 6,5 ​​días, el presunto intervalo generacional. Se correlaciona con un aumento significativo en la tasa de infección por COVID-19 en el Reino Unido , asociado en parte con la mutación N501Y . Hubo alguna evidencia de que esta variante tenía un 40-80% más de transmisibilidad (con la mayoría de las estimaciones ubicadas en el extremo medio a superior de este rango), y los primeros análisis sugirieron un aumento en la letalidad, aunque un trabajo más reciente no ha encontrado evidencia de un aumento virulencia. En mayo de 2021, la variante Alpha se había detectado en unos 120 países.

B.1.1.7 con E484K

Variant of Concern 21FEB-02 (anteriormente escrito como VOC -202102/02), descrito por Public Health England (PHE) como "B.1.1.7 con E484K" es del mismo linaje en el sistema de nomenclatura Pango, pero tiene un adicional Mutación E484K . Al 17 de marzo de 2021, hay 39 casos confirmados de VOC -21FEB-02 en el Reino Unido. El 4 de marzo de 2021, los científicos informaron B.1.1.7 con mutaciones E484K en el estado de Oregon . En 13 muestras de prueba analizadas, una tenía esta combinación, que parecía haber surgido de manera espontánea y local, en lugar de ser importada. Otros nombres para esta variante incluyen B.1.1.7 + E484K y B.1.1.7 Lineage con S: E484K.

Beta (linaje B.1.351)

El 18 de diciembre de 2020, la variante 501.V2 , también conocida como 501.V2, 20H (V2), 20H / 501Y.V2 (anteriormente 20C / 501Y.V2), 501Y.V2, VOC-20DEC-02 (anteriormente VOC - 202012/02), o el linaje B.1.351, fue detectado por primera vez en Sudáfrica y reportado por el departamento de salud del país . Ha sido etiquetado como variante Beta por la OMS. Investigadores y funcionarios informaron que la prevalencia de la variante era mayor entre los jóvenes sin condiciones de salud subyacentes y, en comparación con otras variantes, resulta más frecuente en enfermedades graves en esos casos. El departamento de salud de Sudáfrica también indicó que la variante puede estar impulsando la segunda ola de la epidemia de COVID-19 en el país debido a que la variante se propaga a un ritmo más rápido que otras variantes anteriores del virus.

Los científicos notaron que la variante contiene varias mutaciones que le permiten adherirse más fácilmente a las células humanas debido a las siguientes tres mutaciones en el dominio de unión al receptor (RBD) en la glicoproteína de pico del virus: N501Y , K417N y E484K . La mutación N501Y también se ha detectado en el Reino Unido.

Gamma (linaje P.1)

Se detectó la variante Gamma o linaje P.1, denominada Variant of Concern 21JAN-02 (anteriormente VOC-202101/02) por Public Health England, 20J (V3) o 20J / 501Y.V3 por Nextstrain , o solo 501Y.V3 en Tokio el 6 de enero de 2021 por el Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas (NIID). Ha sido etiquetado como variante Gamma por la OMS. La nueva variante se identificó por primera vez en cuatro personas que llegaron a Tokio después de viajar desde el estado brasileño de Amazonas el 2 de enero de 2021. El 12 de enero de 2021, el Centro CADDE Brasil-Reino Unido confirmó 13 casos locales de la nueva variante Gamma en la selva amazónica. Esta variante de SARS-CoV-2 se ha denominado linaje P.1 (aunque es descendiente de B.1.1.28, el nombre B.1.1.28.1 no está permitido y, por lo tanto, el nombre resultante es P.1), y tiene 17 cambios de aminoácidos únicos, 10 de los cuales en su proteína de pico, incluidas las tres mutaciones preocupantes: N501Y , E484K y K417T.

Las mutaciones N501Y y E484K favorecen la formación de un complejo estable RBD-hACE2, mejorando así la afinidad de unión de RBD a hACE2. Sin embargo, la mutación K417T desfavorece la formación de complejos entre RBD y hACE2, que se ha demostrado que reduce la afinidad de unión.

La nueva variante estuvo ausente en las muestras recolectadas de marzo a noviembre de 2020 en Manaus, estado de Amazonas , pero se detectó para la misma ciudad en el 42% de las muestras entre el 15 y el 23 de diciembre de 2020, seguida por el 52,2% entre el 15 y el 31 de diciembre y 85,4% durante el 1 al 9 de enero de 2021. Un estudio encontró que las infecciones por Gamma pueden producir casi diez veces más carga viral en comparación con las personas infectadas por uno de los otros linajes identificados en Brasil (B.1.1.28 o B.1.195). Gamma también mostró una transmisibilidad 2,2 veces mayor con la misma capacidad de infectar tanto a adultos como a personas mayores, lo que sugiere que los linajes P.1 y P.1 tienen más éxito en infectar a humanos más jóvenes independientemente del sexo.

Un estudio de muestras recolectadas en Manaos entre noviembre de 2020 y enero de 2021, indicó que la variante Gamma es 1.4-2.2 veces más transmisible y demostró ser capaz de evadir entre el 25% y el 61% de la inmunidad heredada de enfermedades anteriores por coronavirus, lo que lleva a la posibilidad de reinfección después de la recuperación de una infección anterior por COVID-19. En cuanto a la tasa de letalidad, las infecciones por Gamma también resultaron ser entre un 10% y un 80% más letales.

Un estudio encontró que las personas completamente vacunadas con Pfizer o Moderna tienen un efecto de neutralización significativamente menor contra Gamma, aunque el impacto real en el curso de la enfermedad es incierto. Un estudio de pre-impresión por la Fundación Oswaldo Cruz, publicado a principios de abril encontrado que el rendimiento real de las personas con la dosis inicial de la Sinovac 's Coronavac vacuna tuvo una eficacia tasa de aproximadamente el 50%. Esperaban que la eficacia fuera mayor después de la segunda dosis. A julio de 2021, el estudio está en curso.

Los datos preliminares de dos estudios indican que la vacuna Oxford-AstraZeneca es eficaz contra la variante Gamma, aunque aún no se ha publicado el nivel exacto de eficacia. Los datos preliminares de un estudio realizado por el Instituto Butantan sugieren que CoronaVac también es eficaz contra la variante Gamma, y ​​hasta julio de 2021 aún no se ha ampliado para obtener datos definitivos.

Delta (linaje B.1.617.2)

La variante Delta, también conocida como B.1.617.2, G / 452R.V3, 21A o 21A / S: 478K, es una variante globalmente dominante que se extendió a al menos 185 países. Fue descubierto por primera vez en la India . Descendiente del linaje B.1.617, que también incluye la variante Kappa bajo investigación, se descubrió por primera vez en octubre de 2020 y desde entonces se ha extendido internacionalmente. El 6 de mayo de 2021, los científicos británicos declararon B.1.617.2 (que carece notablemente de la mutación en E484Q) como una "variante de preocupación", y la etiquetaron como VOC-21APR-02, después de señalar evidencia de que se propaga más rápidamente que la versión original. del virus y podría propagarse más rápido o tan rápido como Alpha. Lleva mutaciones L452R y P681R en Spike; a diferencia de Kappa, lleva T478K pero no E484Q.

El 3 de junio de 2021, Public Health England informó que doce de las 42 muertes por la variante Delta en Inglaterra estaban entre las completamente vacunadas y que se estaba propagando casi dos veces más rápido que la variante Alpha. También el 11 de junio, el Centro Médico Foothills en Calgary, Canadá, informó que la mitad de sus 22 casos de la variante Delta ocurrieron entre los que estaban completamente vacunados.

En junio de 2021, comenzaron a aparecer informes de una variante de Delta con la mutación K417N. La mutación, también presente en las variantes Beta y Gamma, generó preocupaciones sobre la posibilidad de una menor efectividad de las vacunas y los tratamientos con anticuerpos y un mayor riesgo de reinfección. La variante, denominada "Delta con K417N" por Public Health England, incluye dos clados correspondientes a los linajes Pango AY.1 y AY.2. Ha sido apodado "Delta plus" de "Delta plus K417N". El nombre de la mutación, K417N, se refiere a un intercambio en el que la lisina (K) se reemplaza por asparagina (N) en la posición 417. El 22 de junio, el Ministerio de Salud y Bienestar Familiar de la India declaró la variante "Delta plus" de COVID-19. una variante preocupante después de que se informaron 22 casos de la variante en la India. Después del anuncio, los principales virólogos dijeron que no había datos suficientes para respaldar el etiquetado de la variante como una variante distinta de preocupación, lo que apunta al pequeño número de pacientes estudiados.

Variantes de interés (OMS)

A continuación se enumeran las variantes de interés (VOI) que, a partir de agosto de 2021, están reconocidas por la Organización Mundial de la Salud . Otras organizaciones, como los CDC en los Estados Unidos, a veces pueden usar una lista ligeramente diferente.

Lambda (linaje C.37)

La variante Lambda, también conocida como linaje C.37, se detectó por primera vez en Perú en agosto de 2020 y fue designada por la OMS como variante de interés el 14 de junio de 2021. Se extendió a al menos 30 países de todo el mundo y, a partir de En julio de 2021, se desconoce si es más infeccioso y resistente a las vacunas que otras cepas.

Mu (linaje B.1.621)

La variante Mu, también conocida como linaje B.1.621, se detectó por primera vez en Colombia en enero de 2021 y fue designada por la OMS como variante de interés el 30 de agosto de 2021. Ha habido brotes en América del Sur y Europa.

Antiguas variantes de interés

Épsilon (linajes B.1.429, B.1.427, CAL.20C)

La variante o linaje Epsilon B.1.429, también conocida como CAL.20C o CA  VUI1, 21C o 20C / S: 452R, se define por cinco mutaciones distintas (I4205V y D1183Y en el gen ORF1ab, y S13I, W152C, L452R en el gen S de la proteína de pico), de los cuales el L452R (previamente también detectado en otros linajes no relacionados) fue de particular preocupación. Desde el 17 de marzo al 29 de junio de 2021, los CDC enumeraron B.1.429 y B.1.427 relacionado como "variantes de preocupación". A partir de julio de 2021, la OMS ya no considera a Epsilon como una variante de interés, ya que fue superada por Alpha.

Desde septiembre de 2020 hasta enero de 2021, fue entre un 19% y un 24% más transmisible que las variantes anteriores en California. La neutralización contra ella por anticuerpos de infecciones naturales y vacunaciones se redujo moderadamente, pero siguió siendo detectable en la mayoría de las pruebas de diagnóstico.

Epsilon (CAL.20C) fue observado por primera vez en julio de 2020 por investigadores del Centro Médico Cedars-Sinai , California , en una de las 1,230 muestras de virus recolectadas en el condado de Los Ángeles desde el inicio de la epidemia de COVID-19 . No se volvió a detectar hasta septiembre, cuando reapareció entre las muestras en California, pero los números se mantuvieron muy bajos hasta noviembre. En noviembre de 2020, la variante Epsilon representó el 36 por ciento de las muestras recolectadas en el Centro Médico Cedars-Sinai, y para enero de 2021, la variante Epsilon representó el 50 por ciento de las muestras. En un comunicado de prensa conjunto de la Universidad de California, San Francisco , Departamento de Salud Pública de California , y el Departamento de Salud Pública del Condado de Santa Clara , la variante también se detectó en varios condados del norte de California. De noviembre a diciembre de 2020, la frecuencia de la variante en casos secuenciados del norte de California aumentó del 3% al 25%. En una preimpresión, CAL.20C se describe como perteneciente al clado 20C y aporta aproximadamente el 36% de las muestras, mientras que una variante emergente del clado 20G representa aproximadamente el 24% de las muestras en un estudio centrado en el sur de California. Sin embargo, tenga en cuenta que en los EE. UU. En su conjunto, el clado 20G predomina, a partir de enero de 2021. Tras el número creciente de Epsilon en California, la variante se ha detectado con frecuencias variables en la mayoría de los estados de EE. UU. Se han detectado pequeñas cantidades en otros países de América del Norte y en Europa, Asia y Australia. Después de un aumento inicial, su frecuencia se redujo rápidamente a partir de febrero de 2021, ya que estaba siendo superado por el Alpha más transmisible . En abril, Epsilon seguía siendo relativamente frecuente en partes del norte de California, pero prácticamente había desaparecido del sur del estado y nunca había podido establecerse en otro lugar; solo el 3,2% de todos los casos en los Estados Unidos fueron épsilon, mientras que más de dos tercios fueron alfa.

Zeta (linaje P.2)

La variante Zeta o linaje P.2, un sublinaje de B.1.1.28 como Gamma (P.1), se detectó por primera vez en circulación en el estado de Río de Janeiro ; alberga la mutación E484K, pero no las mutaciones N501Y y K417T. Evolucionó de forma independiente en Río de Janeiro sin estar directamente relacionado con la variante Gamma de Manaus. Aunque anteriormente Zeta fue etiquetado como una variante de interés, a partir de julio de 2021, la OMS ya no lo considera como tal.

Theta (linaje P.3)

El 18 de febrero de 2021, el Departamento de Salud de Filipinas confirmó la detección de dos mutaciones de COVID-19 en Visayas centrales después de que se enviaran muestras de pacientes para someterse a la secuenciación del genoma. Posteriormente, las mutaciones se denominaron E484K y N501Y, que se detectaron en 37 de 50 muestras, y ambas mutaciones coexistieron en 29 de ellas.

El 13 de marzo, el Departamento de Salud confirmó que las mutaciones constituyen una variante que fue designada como linaje P.3. Ese mismo día, también confirmó el primer caso de COVID-19 causado por la variante Gamma en el país. Filipinas tenía 98 casos de la variante Theta el 13 de marzo. El 12 de marzo se anunció que Theta también había sido detectada en Japón. El 17 de marzo, el Reino Unido confirmó sus dos primeros casos, en los que PHE lo denominó VUI-21MAR-02. El 30 de abril de 2021, Malasia detectó 8 casos de la variante Theta en Sarawak.

A partir de julio de 2021, la OMS ya no considera a Theta como una variante de interés.

Eta (linaje B.1.525)

La variante Eta o linaje B.1.525, también llamada VUI -21FEB-03 (anteriormente VUI-202102/03) por Public Health England (PHE) y anteriormente conocida como UK1188, 21D o 20A / S: 484K, no lleva el mismo La mutación N501Y se encuentra en Alfa , Beta y Gamma , pero lleva la misma mutación E484K que se encuentra en las variantes Gamma, Zeta y Beta, y también lleva la misma deleción ΔH69 / ΔV70 (una eliminación de los aminoácidos histidina y valina en posiciones 69 y 70) como se encuentra en Alpha, variante N439K (B.1.141 y B.1.258) y variante Y453F ( Cluster 5 ). Eta se diferencia de todas las demás variantes por tener tanto la mutación E484K como una nueva mutación F888L (una sustitución de fenilalanina (F) por leucina (L) en el dominio S2 de la proteína de pico). Al 5 de marzo de 2021, se había detectado en 23 países. También se ha informado en Mayotte , el departamento / región de ultramar de Francia. Los primeros casos se detectaron en diciembre de 2020 en el Reino Unido y Nigeria, y al 15 de febrero de 2021, se había producido con la frecuencia más alta entre las muestras de este último país. El 24 de febrero se encontraron 56 casos en el Reino Unido. Dinamarca, que secuencia todos sus casos de COVID-19, encontró 113 casos de esta variante del 14 de enero al 21 de febrero de 2021, de los cuales siete estaban directamente relacionados con viajes al extranjero a Nigeria.

A partir de julio de 2021, los expertos del Reino Unido lo están estudiando para determinar cuánto riesgo podría ser. Actualmente se considera una "variante que se está investigando", pero, a la espera de un estudio más a fondo, puede convertirse en una " variante que suscita preocupación ". Ravi Gupta , de la Universidad de Cambridge, dijo en una entrevista con la BBC que el linaje B.1.525 parecía tener "mutaciones significativas" ya observadas en algunas de las otras variantes más nuevas, lo que significa que su efecto probable es hasta cierto punto más predecible.

Iota (linaje B.1.526)

En noviembre de 2020, se descubrió una variante mutante en la ciudad de Nueva York, que recibió el nombre de linaje B.1.526. Hasta el 11 de abril de 2021, la variante se ha detectado en al menos 48 estados de EE. UU. Y 18 países. En un patrón que reflejaba a Epsilon, Iota inicialmente pudo alcanzar niveles relativamente altos en algunos estados, pero en mayo de 2021 fue superado por Delta y Alpha, que son más transmisibles.

Kappa (linaje B.1.617.1)

La variante Kappa es uno de los tres sublinajes del linaje B.1.617 . También se conoce como linaje B.1.617.1, 21B o 21A / S: 154K, y se detectó por primera vez en India en diciembre de 2020. A fines de marzo de 2021, Kappa representaba más de la mitad de las secuencias enviadas desde India . El 1 de abril de 2021, Public Health England lo designó como una variante bajo investigación (VUI-21APR-01). Tiene las mutaciones notables L452R, E484Q, P681R.

Alertas para mayor seguimiento (OMS)

Definido como variantes con cambios genéticos que se sospecha que afectan las características del virus y alguna indicación de suponer un riesgo futuro, pero con evidencia poco clara de impacto fenotípico o epidemiológico, que requieren un mayor seguimiento y evaluación repetida después de nueva evidencia.

A 16 de septiembre de 2021

Linaje Pango	Clado GISAID	Clado Nextstrain	Muestras más tempranas	Fecha de designación	Notas
R.1	GRAMO		2021-01	2021-04-07	Variante de interés del Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas de Japón . Tiene la mutación E484K en el dominio de unión al receptor y la mutación W152L en el dominio N terminal, las cuales pueden tener implicaciones para el escape inmunológico. Se ha encontrado en 30 países con 7057 casos en Japón y 1249 casos en los Estados Unidos. Un pequeño estudio en los EE. UU. Encontró que la vacuna Pfizer-Biontech fue 94% efectiva contra la hospitalización y la muerte por R.1 durante un brote. En Japón, siguen apareciendo casos de R.1.
B.1.466.2	GH		2020-11	2021-04-28	Primero muestreado en Indonesia .
B.1.1.318	GRAMO		2021-01	2021-06-02	Public Health England VUI (VUI-21FEB-04, anteriormente VUI-202102/04) el 24 de febrero de 2021. Se detectaron 16 casos en el Reino Unido. Se detectaron 155 casos en la provincia de Ontario, Canadá, entre el 30 de mayo y el 26 de junio de 2021. Se llamó Fin-796H cuando se descubrió en Finlandia , lo que indica la mutación de D796H, y se determina que se origina en Nigeria . La variante también presenta la mutación E484K.
B.1.1.519	GRAMO	20B / S.732A	2020-11	2021-06-02
C.36.3	GRAMO		2021-01	2021-06-16
B.1.214.2	GRAMO		2020-11	2021-06-30
B.1.427 B.1.429	GH / 452R.V1	21C	2020-03	2021-07-06	Epsilon , muestreado por primera vez en los Estados Unidos .
B.1.1.523	GRAMO		2020-05	2021-07-14
B.1.619	GRAMO		2020-05	2021-07-14
B.1.620	GRAMO	20A / S.126A	2020-11	2021-07-14	Descubierta en Lituania en marzo de 2021, también conocida como la 'cepa lituana'. Se encontró en África Central y en América del Norte. Además de Lituania, otros países europeos como Francia y Bélgica también han encontrado presencia de esta variante. Este linaje tiene 23 mutaciones y deleciones en comparación con la cepa de referencia, algunas de las cuales son mutaciones únicas. El linaje contiene una mutación E484K. D614G, una mutación presente en la mayoría de las cepas circulantes, también se encuentra en esta variante. Otras mutaciones notables incluyen P681H y S477N.
C.1.2	GRAMO		2021-05	2021-09-01	Identificado en mayo de 2021 cuando representó el 0.2% (2/1054) de los genomas secuenciados en Sudáfrica , aumentando en junio al 1.6% (25/2177), y en julio al 2.0% (26/1326), similar a los aumentos de la detección temprana de las variantes Beta y Delta. En junio de 2021 se detectó en Inglaterra y China , y hasta el 13 de agosto de 2021 también se había detectado en Portugal , Suiza , República Democrática del Congo (RDC), Mauricio y Nueva Zelanda . C.1.2 contiene múltiples sustituciones (C136F, R190S, D215G, Y449H, N484K, N501Y , H655Y, N679K y T859N) y deleciones (Y144del, L242-A243del) dentro de la proteína de pico. Según los informes, la variante muta a una tasa más alta que otros VOC.

Otras variantes notables

El linaje B.1.1.207 se secuenció por primera vez en agosto de 2020 en Nigeria; las implicaciones para la transmisión y la virulencia no están claras, pero ha sido catalogado como una variante emergente por los Centros para el Control de Enfermedades de EE. UU . Secuenciada por el Centro Africano de Excelencia para la Genómica de Enfermedades Infecciosas en Nigeria, esta variante tiene una mutación P681H, compartida en común con la variante Alfa . No comparte otras mutaciones con la variante Alpha y, a fines de diciembre de 2020, esta variante representa alrededor del 1% de los genomas virales secuenciados en Nigeria, aunque esto puede aumentar. A mayo de 2021, se ha detectado el linaje B.1.1.207 en 10 países.

El linaje B.1.1.317, aunque no se considera una variante de preocupación , es digno de mención porque Queensland Health obligó a 2 personas que se sometieron a cuarentena en un hotel en Brisbane , Australia, a someterse a una cuarentena de 5 días adicionales además de los 14 días obligatorios después de que se confirmó. estaban infectados con esta variante.

Se informó que el linaje B.1.616, identificado en el oeste de Francia a principios de enero de 2021 y designado por la OMS como "Variante en investigación" en marzo de 2021, era difícil de detectar a partir del método de muestreo por frotis nasofaríngeo para la detección del coronavirus y la necesidad de detección del virus. depender de muestras del tracto respiratorio inferior.

El linaje B.1.618 se aisló por primera vez en octubre de 2020. Tiene la mutación E484K en común con varias otras variantes y mostró una propagación significativa en abril de 2021 en Bengala Occidental , India. Al 23 de abril de 2021, la base de datos PANGOLIN mostraba 135 secuencias detectadas en India, con números de una sola cifra en cada uno de los otros ocho países del mundo.

Mutaciones de sentido erróneo notables

Se han observado varias mutaciones sin sentido del SARS-CoV-2.

del 69-70

El nombre de la mutación, del 69-70, o 69-70 del, u otras notaciones similares, se refiere a la eliminación del aminoácido en la posición 69 a 70. La mutación se encuentra en la variante Alpha y podría conducir a "spike falla de la diana del gen "y dar como resultado un resultado falso negativo en la prueba del virus de PCR.

RSYLTPGD246-253N

También denominada del 246-252, u otra expresión similar, se refiere a la eliminación de un aminoácido de la posición 246 a 252, en el dominio N-terminal de la proteína espiga, acompañado de un reemplazo del ácido aspártico (D ) en la posición 253 para la asparagina (N).

La mutación por deleción de 7 aminoácidos se describe actualmente como única en la variante Lambda, y se la ha atribuido como una de las causas del aumento de la capacidad de la cepa para escapar de los anticuerpos neutralizantes según el papel preimpreso.

N440K

El nombre de la mutación, N440K, se refiere a un intercambio en el que la asparagina (N) se reemplaza por lisina (K) en la posición 440.

Se ha observado que esta mutación en cultivos celulares es 10 veces más infecciosa en comparación con la cepa A2a previamente extendida (sustitución A97V en la secuencia RdRP) y 1000 veces más en la cepa A3i menos extendida (sustitución D614G en Spike y sustitución de a y P323L en RdRP ). Estuvo involucrado en rápidos aumentos de casos de Covid en India en mayo de 2021. India tiene la mayor proporción de variantes mutadas de N440K, seguida de Estados Unidos y Alemania.

G446V

El nombre de la mutación, G446V, se refiere a un intercambio mediante el cual la glicina (G) se reemplaza por valina (V) en la posición 446.

Se dice que la mutación, identificada en Japón entre los viajeros entrantes a partir de mayo, y entre 33 muestras de individuos relacionados con los Juegos Olímpicos de Tokio 2020 y los Juegos Paralímpicos de Tokio 2020 , podría afectar la afinidad de múltiples anticuerpos monoclonales , aunque su impacto clínico contra el el uso de medicamentos de anticuerpos aún no se conoce.

L452R

El nombre de la mutación, L452R, se refiere a un intercambio mediante el cual la leucina (L) se reemplaza por arginina (R) en la posición 452.

L452R se encuentra en las variantes Delta y Kappa que circularon por primera vez en la India, pero desde entonces se han extendido por todo el mundo. L452R es una mutación relevante en esta cepa que mejora la capacidad de unión al receptor ACE2 y puede reducir la unión de los anticuerpos estimulados por la vacuna a esta proteína espiga alterada.

L452R, según muestran algunos estudios, incluso podría hacer que el coronavirus sea resistente a las células T, que son una clase de células necesarias para atacar y destruir las células infectadas por virus. Son diferentes de los anticuerpos que son útiles para bloquear las partículas de coronavirus y evitar su proliferación.

Y453F

El nombre de la mutación, Y453F, se refiere a un intercambio por el cual la tirosina (Y) se reemplaza por fenilalanina (F) en la posición 453. Se ha encontrado que la mutación está potencialmente relacionada con la propagación del SARS-CoV-2 entre visones en los Países Bajos. en 2020.

S477G / N

Una región altamente flexible en el dominio de unión al receptor (RBD) del SARS-CoV-2, comenzando desde el residuo 475 y continuando hasta el residuo 485, se identificó utilizando métodos bioinformáticos y estadísticos en varios estudios. La Universidad de Graz y la empresa de biotecnología Innophore han demostrado en una publicación reciente que, estructuralmente, la posición S477 muestra la mayor flexibilidad entre ellas.

Al mismo tiempo, S477 es hasta ahora el residuo de aminoácido intercambiado con mayor frecuencia en los RBD de mutantes de SARS-CoV-2. Mediante el uso de simulaciones de dinámica molecular de RBD durante el proceso de unión a hACE2, se ha demostrado que tanto S477G como S477N fortalecen la unión del pico de SARS-COV-2 con el receptor hACE2. El desarrollador de vacunas BioNTech hizo referencia a este intercambio de aminoácidos como relevante con respecto al diseño futuro de la vacuna en una preimpresión publicada en febrero de 2021.

E484Q

El nombre de la mutación, E484Q, se refiere a un intercambio mediante el cual el ácido glutámico (E) se reemplaza por glutamina (Q) en la posición 484.

La variante Kappa que circula en India tiene E484Q. Estas variantes fueron inicialmente (pero engañosamente) referidas como un "doble mutante". E484Q puede mejorar la capacidad de unión al receptor ACE2 y puede reducir la capacidad de los anticuerpos estimulados por la vacuna para unirse a esta proteína de pico alterada.

E484K

El nombre de la mutación, E484K, se refiere a un intercambio mediante el cual el ácido glutámico (E) se reemplaza por lisina (K) en la posición 484. Se le conoce como "Eeek".

Se ha informado que E484K es una mutación de escape (es decir, una mutación que mejora la capacidad de un virus para evadir el sistema inmunológico del huésped ) de al menos una forma de anticuerpo monoclonal contra el SARS-CoV-2, lo que indica que puede haber un "posible cambio en antigenicidad ". La variante Gamma (linaje P.1), la variante Zeta (linaje P.2, también conocida como linaje B.1.1.28.2) y la variante Beta (501.V2) exhiben esta mutación. También se ha detectado un número limitado de genomas del linaje B.1.1.7 con la mutación E484K. Se informa que los anticuerpos monoclonales y derivados del suero son de 10 a 60 veces menos efectivos para neutralizar virus que portan la mutación E484K. El 2 de febrero de 2021, científicos médicos del Reino Unido informaron de la detección de E484K en 11 muestras (de 214.000 muestras), una mutación que puede comprometer la eficacia actual de la vacuna.

F490S

F490S denota un cambio de fenilalanina (F) a serina (S) en la posición 490 del aminoácido .

Es una de las mutaciones encontradas en Lambda, y se ha asociado con una susceptibilidad reducida a los anticuerpos generados por aquellos que fueron infectados con otras cepas, lo que significa que el tratamiento con anticuerpos contra personas infectadas con cepas portadoras de dicha mutación sería menos efectivo.

N501Y

N501Y denota un cambio de asparagina (N) a tirosina (Y) en la posición de aminoácido 501. N501Y ha sido apodado "Nelly".

Este cambio se cree por PHE para aumentar la afinidad de unión debido a su posición dentro de la espiga glicoproteína 's dominio de unión al receptor , que se une ACE2 en las células humanas; los datos también apoyan la hipótesis de una mayor afinidad de unión a partir de este cambio. El modelado de interacción molecular y la energía libre de los cálculos de unión han demostrado que la mutación N501Y tiene la mayor afinidad de unión en las variantes de interés RBD a hACE2. Las variantes con N501Y incluyen Gamma, Alpha (VOC 20DEC-01), Beta y COH.20G / 501Y (identificado en Columbus, Ohio ). Esta última se convirtió en la forma dominante del virus en Columbus a finales de diciembre de 2020 y enero y parece haber evolucionado independientemente de otras variantes.

N501S

N501S denota un cambio de asparagina (N) a serina (S) en la posición de aminoácido 501.

A septiembre de 2021, hay 8 casos de pacientes en todo el mundo infectados con la variante Delta que presentan esta mutación N501S. Como se considera una mutación similar a N501Y, se sospecha que tiene características similares a la mutación N501Y, que se cree que aumenta la infectividad del virus; sin embargo, aún se desconoce el efecto exacto.

D614G

D614G es una mutación sin sentido que afecta a la proteína de pico del SARS-CoV-2. Desde las primeras apariciones en el este de China a principios de 2020, la frecuencia de esta mutación en la población viral mundial ha aumentado durante la pandemia. G ( glicina ) ha reemplazado a D ( ácido aspártico ) en la posición 614 en muchos países, especialmente en Europa, aunque más lentamente en China y el resto de Asia oriental, lo que respalda la hipótesis de que G aumenta la tasa de transmisión, lo que es consistente con títulos virales más altos. e infectividad in vitro. Los investigadores con la herramienta PANGOLIN apodaron esta mutación como "Doug".

En julio de 2020, se informó que la variante D614G SARS-CoV-2 más infecciosa se había convertido en la forma dominante en la pandemia. PHE confirmó que la mutación D614G tenía un "efecto moderado sobre la transmisibilidad" y se estaba rastreando a nivel internacional.

La prevalencia global de D614G se correlaciona con la prevalencia de pérdida del olfato ( anosmia ) como síntoma de COVID-19, posiblemente mediada por una mayor unión del RBD al receptor ACE2 o una mayor estabilidad proteica y, por tanto, una mayor infectividad del epitelio olfatorio .

Las variantes que contienen la mutación D614G se encuentran en el clado G por GISAID y el clado B.1 por la herramienta PANGOLIN .

Q677P / H

El nombre de la mutación, Q677P / H, se refiere a un intercambio mediante el cual la glutamina (Q) se reemplaza por prolina (P) o histidina (H) en la posición 677.

La mutación se ha informado en varios linajes que circulan dentro de los Estados Unidos a fines de 2020 y también en algunos linajes fuera del país. La frecuencia con la que se registra dicha mutación ha aumentado desde finales de 2020 hasta principios de 2021.

P681H

El nombre de la mutación, P681H, se refiere a un intercambio mediante el cual la prolina (P) se reemplaza por histidina (H) en la posición 681.

En enero de 2021, los científicos informaron en un preimpreso que la mutación P681H, un rasgo característico de la variante Alfa y el linaje B.1.1.207 (identificado en Nigeria), está mostrando un aumento exponencial significativo en la frecuencia mundial, siguiendo así una tendencia a ser esperado en el extremo inferior de la curva logística. Esto puede compararse con la tendencia del D614G, que ahora prevalece en todo el mundo.

P681R

El nombre de la mutación, P681R, se refiere a un intercambio mediante el cual la prolina (P) se reemplaza por arginina (R) en la posición 681.

El Consorcio Indio de Genómica del SARS-CoV-2 ( INSACOG ) encontró que además de las dos mutaciones E484Q y L452R, también hay una tercera mutación significativa, P681R en el linaje B.1.617. Las tres mutaciones preocupantes se encuentran en la proteína de pico, la parte operativa del coronavirus que se une a las células receptoras del cuerpo.

A701V

Según los informes iniciales de los medios de comunicación, el Ministerio de Salud de Malasia anunció el 23 de diciembre de 2020 que había descubierto una mutación en el genoma del SARS-CoV-2 que designaron como A701B (sic), entre 60 muestras recolectadas del grupo Benteng Lahad Datu en Sabah . La mutación se caracterizó por ser similar a la encontrada recientemente en ese momento en Sudáfrica, Australia y los Países Bajos, aunque no estaba claro si esta mutación era más infecciosa o agresiva que antes. El gobierno provincial de Sulu en la vecina Filipinas suspendió temporalmente los viajes a Sabah en respuesta al descubrimiento de 'A701B' debido a la incertidumbre sobre la naturaleza de la mutación.

El 25 de diciembre de 2020, el Ministerio de Salud de Malasia describió una mutación A701V circulante y presente en el 85% de los casos (D614G estaba presente en el 100% de los casos) en Malasia. Estos informes también se refirieron a muestras recolectadas del grupo Benteng Lahad Datu. El texto del anuncio se reflejó literalmente en la página de Facebook de Noor Hisham Abdullah , Director General de Salud malayo, quien fue citado en algunos de los artículos de noticias.

La mutación A701V tiene el aminoácido alanina (A) sustituido por valina (V) en la posición 701 de la proteína de pico. A nivel mundial, Sudáfrica, Australia, Países Bajos e Inglaterra también informaron A701V aproximadamente al mismo tiempo que Malasia. En GISAID, se encuentra que la prevalencia de esta mutación es de aproximadamente 0,18%. de los casos.

El 14 de abril de 2021, el Ministerio de Salud de Malasia informó que la tercera ola, que había comenzado en Sabah, ha implicado la introducción de variantes con mutaciones D614G y A701V.

Eficacia diferencial de la vacuna

Consulte también la investigación clínica de la vacuna COVID-19 (efectividad)

Datos y métodos

La secuenciación moderna del ADN , cuando esté disponible, puede permitir la detección rápida (a veces conocida como " detección en tiempo real ") de variantes genéticas que aparecen en patógenos durante los brotes de enfermedades. Mediante el uso de software de visualización de árboles filogenéticos , los registros de las secuencias del genoma se pueden agrupar en grupos de genomas idénticos que contienen todos el mismo conjunto de mutaciones. Cada grupo representa una 'variante', 'clado' o 'linaje', y la comparación de las secuencias permite deducir el camino evolutivo de un virus. Para el SARS-CoV-2, se han generado más de 330.000 secuencias genómicas virales mediante estudios de epidemiología molecular en todo el mundo.

Detección y evaluación de nuevas variantes

El 26 de enero de 2021, el gobierno británico dijo que compartiría sus capacidades de secuenciación genómica con otros países para aumentar la tasa de secuenciación genómica y rastrear nuevas variantes, y anunció una "Plataforma de evaluación de nuevas variantes". En enero de 2021, más de la mitad de toda la secuenciación genómica de COVID-19 se llevó a cabo en el Reino Unido.

Pruebas

El 11 de junio de 2021, Public Health England introdujo un algoritmo de decisión basado en reglas para distinguir entre variantes en los resultados de RT-PCR. El sistema se revisa semanalmente. En particular, las reglas requieren que estén presentes mutaciones específicas en el gen S para cada variante (P681R para Delta, K417N para Beta y K417T para Gamma); el estado de confirmación de la prueba depende también de otros requisitos para la detección o no detección de la presencia o ausencia de estas mutaciones y las mutaciones N501Y y E484K. Cuando el resultado es 'indeterminado', son posibles dos categorías: con o sin E484K. .

Teoría de la incubación para múltiples variantes mutadas

Los investigadores han sugerido que pueden surgir múltiples mutaciones en el curso de la infección persistente de un paciente inmunodeprimido , particularmente cuando el virus desarrolla mutaciones de escape bajo la presión de selección del anticuerpo o el tratamiento con plasma convaleciente , con las mismas deleciones en los antígenos de superficie que se repiten repetidamente en diferentes pacientes. .

Transmisión entre especies

Grupo 5

A principios de noviembre de 2020, el Cluster 5 , también conocido como ΔFVI-spike por el Danish State Serum Institute (SSI), fue descubierto en el norte de Jutlandia , Dinamarca, y se cree que se transmitió de visones a humanos a través de granjas de visones . El 4 de noviembre de 2020, se anunció que la población de visones en Dinamarca sería sacrificada para prevenir la posible propagación de esta mutación y reducir el riesgo de que ocurran nuevas mutaciones. Se introdujeron restricciones de viaje y bloqueo en siete municipios del norte de Jutlandia para evitar que la mutación se propague, lo que podría comprometer las respuestas nacionales o internacionales a la pandemia de COVID-19 . Para el 5 de noviembre de 2020, se habían detectado unos 214 casos humanos relacionados con visones.

La OMS ha declarado que el grupo 5 tiene una "sensibilidad moderadamente disminuida a los anticuerpos neutralizantes". SSI advirtió que la mutación podría reducir el efecto de las vacunas COVID-19 en desarrollo, aunque es poco probable que las inutilice. Tras el bloqueo y las pruebas masivas, SSI anunció el 19 de noviembre de 2020 que el grupo 5 con toda probabilidad se había extinguido. A partir del 1 de febrero de 2021, los autores de un artículo revisado por pares , todos los cuales eran del SSI, evaluaron que el grupo 5 no estaba en circulación en la población humana.

Existe el riesgo de que COVID-19 se transfiera de humanos a otras poblaciones de animales y se combine con otros virus animales para crear aún más variantes que son peligrosas para los humanos.

Ver también

• RaTG13 , el segundo más cercano conocido en relación con el SARS-CoV-2
• Prevención de pandemias § Vigilancia y mapeo

Notas

Referencias

Otras lecturas

enlaces externos

Scholia tiene un perfil para variantes de SARS-CoV-2 (Q104450895) .

• CoVariantes
• Cov-Linajes
• GISAID - Variantes de hCov19