Grapa ST - ST staple
La grapa ST es un motivo de residuo común de cuatro o cinco aminoácidos en proteínas y polipéptidos con serina o treonina como residuo C-terminal . Se caracteriza por un enlace de hidrógeno simple entre el grupo hidroxilo de la serina o treonina (en el residuo i + 3 o i + 4) y el grupo carbonilo de la cadena principal del residuo i . Los motivos son de dos tipos, dependiendo de si el motivo tiene 4 o 5 residuos. La mayoría de las grapas ST se producen junto con una hélice alfa y, por lo general, se asocian con una ligera curva en la hélice. Hay dos sitios web disponibles para encontrar y examinar los productos básicos de ST en proteínas: Proteínas Motivadas y PDBeMotif .
Grapa ST de cinco residuos. Este pentapéptido muestra una treonina C-terminal más los átomos de la cadena principal de los cuatro residuos precedentes. Se omiten los átomos de hidrógeno más algunos átomos terminales de la cadena principal. Gris carbón, rojo oxígeno y azul nitrógeno. El enlace de hidrógeno se muestra como una línea de puntos grises.
Referencias
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