Represión del elemento de expresión génica de choque térmico (ROSE) - Repression of heat shock gene expression (ROSE) element
| Represión del elemento de expresión génica de choque térmico (ROSE) | |
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| Identificadores | |
| Símbolo | ROSA |
| Rfam | RF00435 |
| Otros datos | |
| Tipo de ARN | Cis-reg ; termorregulador |
| Dominio (s) | Bacterias |
| ASI QUE | Entonces: 0000204 |
| Estructuras PDB | PDBe |
El elemento de represión de la expresión génica de choque térmico (ROSE) es un elemento de ARN que se encuentra en el 5 'UTR de algunos ARNm de proteínas de choque térmico . El elemento ROSE es un termómetro de ARN que regula negativamente la expresión de genes de choque térmico . Se cree que la estructura secundaria se ve alterada por la temperatura, por lo que es un termómetro de ARN. Esta estructura bloquea el acceso al sitio de unión del ribosoma a temperaturas normales. Sin embargo, durante el choque térmico, la estructura cambia liberando el sitio de unión del ribosoma y permitiendo que se produzca la expresión.
Se ha determinado una estructura parcial de este elemento de ARN mediante RMN .
ROSA 1 y ROSA AT2
ROSE 1 y ROSE AT2 son ejemplos específicos de elementos ROSE. ROSE 1 se encuentra en Bradyrhizobium japonicum, mientras que ROSE AT2 es un elemento estrechamente relacionado de Agrobacterium tumefaciens . Los dos elementos de ARN tienen estructuras secundarias similares con ROSE 1 que tiene una horquilla adicional . Todos los elementos ROSE contienen una característica 'G abultada' opuesta al sitio de unión de la secuencia de Shine-Dalgarno , sin este nucleótido, el termómetro de ARN pierde su sensibilidad a la temperatura.
IpbA
La expresión de la proteína de choque térmico IpbA en especies de Pseudomonas se controla mediante un termómetro de ARN tipo ROSE. Este termómetro solo consta de dos horquillas. Inhibe la traducción de IpbA a bajas temperaturas y permite la traducción cuando aumenta la temperatura.
Elementos rhlA y lsdI ROSE
Los factores de virulencia dependientes de la detección de quórum de Pseudomonas aeruginosa se pueden termorregular. El termómetro ROSE presente en el 5'UTR de rhlA y el termómetro tipo ROSE en el 5'UTR de lasI bloquean la traslación a temperaturas más bajas.
Ver también
Referencias
Otras lecturas
- De La Fuente, M .; Valera, S .; Martínez-Guitarte, JL (2012). "NcRNAs y termorregulación: una vista en procariotas y eucariotas" . Cartas FEBS . 586 (23): 4061–4069. doi : 10.1016 / j.febslet.2012.10.018 . PMID 23098758 .
enlaces externos
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