Plasmapper - Plasmapper
| Contenido | |
|---|---|
| Descripción | Servidor de mapeo de plásmidos |
| Tipos de datos capturados |
Entrada de datos : secuencia de plásmido (formato FASTA); Salida de datos : mapa de texto e imagen del plásmido (PNG, JPG y SVG) |
| Contacto | |
| Centro de Investigación | Universidad de Alberta |
| Laboratorio | Dr. David Wishart |
| Cita primaria | PlasMapper: un servidor web para dibujar y anotar automáticamente mapas de plásmidos. |
| Acceso | |
| Sitio web | http://wishart.biology.ualberta.ca/PlasMapper/ |
| URL de descarga | http://wishart.biology.ualberta.ca/PlasMapper/ |
| Diverso | |
| Política de curación | Seleccionado manualmente |
PlasMapper (Plasmid Mapper) es un servidor web de libre acceso que genera y anota automáticamente mapas de plásmidos circulares de alta calidad . Es un servicio en línea particularmente útil para biólogos moleculares que deseen generar mapas de plásmidos sin tener que comprar o mantener un software comercial costoso. PlasMapper acepta la secuencia de ADN del plásmido / vector como entrada ( formato FASTA ) y utiliza la coincidencia de patrones de secuencia y la alineación de secuencia BLAST para identificar y etiquetar automáticamente promotores comunes, terminadores, sitios de clonación, sitios de restricción , genes indicadores , etiquetas de afinidad , genes marcadores seleccionables , orígenes de replicación y marcos de lectura abiertos . PlasMapper luego reformatea y presenta las características identificadas tanto en una forma textual simple como en una imagen multicolor de alta resolución.
La apariencia y el contenido de la salida se pueden personalizar de numerosas formas utilizando una variedad de opciones en línea. Las imágenes PlasMapper se pueden renderizar en formatos rasterizados ( Portable Network Graphics (PNG) y JPG ) y gráficos vectoriales escalables ( SVG ) para adaptarse a una variedad de necesidades o preferencias del usuario. Las imágenes y la salida textual son de calidad suficiente para que puedan usarse directamente en publicaciones o presentaciones.