Natronomonas -Natronomonas
Natronomonas | |
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Natronomonas
Kamekura y col. 1997
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Especies | |
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En taxonomía , Natronomonas es un género de Halobacteriaceae .
Descripción y significado
Natronomonas pharaonis es un aeróbico , extremadamente haloalkaliphilic archaeon que crece de manera óptima en 3,5 M de cloruro de sodio y a pH 8,5, pero es sensible a las altas magnesio concentraciones.
Estructura del genoma
El genoma de Natronomonas pharaonis consta de tres replicones circulares, el cromosoma que tiene una longitud de 2.595.221 pb, un plásmido haloarqueal típico de 131 kb y un plásmido multicopia único de 23 kb. Su cromosoma tiene un alto contenido de G + C (63,4%). Además, una alta proporción de aminoácidos ácidos (promedio 19,3%) se encuentra en las proteínas de N. pharaonis, lo que da como resultado puntos isoeléctricos bajos (pI promedio 4,6). Esta se considera una de las características adaptativas de las haloarchaea, que se sabe que aplican la estrategia de entrada de sal (altas concentraciones internas de sal) para sobrevivir en su entorno hipersalino (Falb et al.). Además, es de destacar que debido a que la arqueona carece de la codificación genética de las enzimas clave para las vías glucolíticas, no es capaz de utilizar el azúcar.
Estructura y metabolismo celular
Natronomonas , como los otros miembros de Halobacteriaceae, tiene características fisiológicas distintas porque no solo requiere altas concentraciones de NaCl sino también un pH alto y concentraciones bajas de Mg2 + para su crecimiento. Por lo general, utiliza aminoácidos como fuente de carbono, pero la serie de estudios descubrió que el arqueón tiene un alto grado de autosuficiencia nutricional. Además, a diferencia de otros alcalófilos, que usan sodio Na + en lugar de protones H + como ion de acoplamiento entre la cadena respiratoria y la ATP sintasa, Natronomonas usa protones como ion de acoplamiento.
El archaeon crece en condiciones altamente alcalinas de pH alrededor de 11, lo que provoca niveles reducidos de amoníaco además de una baja disponibilidad de iones metálicos. El análisis del genoma muestra que, en su proceso de metabolismo del nitrógeno, la arqueona tiene tres mecanismos que suministran amoníaco, que luego se asimila en glutamato: absorción directa de amoníaco, absorción de nitrato y posterior reducción a amoníaco, y absorción de urea que es dividida por ureasa para liberar amoniaco. Las flechas verdes en la figura representan los transportadores de amoníaco ( AmtB ), nitrato (NarK) y urea (UrtA-E) de fuente de nitrógeno exógeno , y las flechas azules representan las enzimas para la reducción de nitrato (NarB + Nir A) y la hidrólisis. de urea (UreA-G). Otras abreviaturas: GlnA + GltB = glutamato; 2-OG = oxoglutarato; fdx = ferredoxina.
Es probable que Natronomonas use ferredoxina y no NADH como donante de electrones para las tres conversiones reductoras. Esto es evidente por la aparición de residuos de unión de ferredoxina conservados dentro de la proteína NirA de N. pharaonis y la dependencia de ferredoxina de nitrato y nitrito reductasas en el halófilo Haloferax mediterranei .
Ecología
Las cepas de N. pharaonis se aislaron por primera vez de lagos de soda altamente salinos en Egipto y Kenia, que muestran valores de pH alrededor de 11.
Referencias
Otras lecturas
Revistas científicas
- Oren A; Ventosa A (2000). "Subcomité del Comité Internacional de Bacteriología Sistemática sobre la taxonomía de Halobacteriaceae. Actas de las reuniones, 16 de agosto de 1999, Sydney, Australia" . En t. J. Syst. Evol. Microbiol . 50 (3): 1405–1407. doi : 10.1099 / 00207713-50-3-1405 . PMID 10843089 .
- Kamekura M; Dyall-Smith ML; Upasani V; Ventosa A; et al. (1997). "Diversidad de halobacterias alcalifílicas: propuestas para la transferencia de Natronobacterium vacuolatum, Natronobacterium magadii y Natronobacterium pharaonis a Halorubrum, Natrialba y Natronomonas gen. Nov., Respectivamente, como Halorubrum vacuolatum comb. Nov., Natrialba magadii comb. Comb. Nov., Natrialba magadii comb. pharaonis comb. nov., respectivamente " . En t. J. Syst. Bacteriol . 47 (3): 853–857. doi : 10.1099 / 00207713-47-3-853 . PMID 9226918 .
- Natarajan, Janani; Schultz, Anita; Kurz, Ursula; Schultz, Joachim E. (2014). "Caracterización bioquímica del dominio HAMP en tándem de Natronomonas pharaonis como transductor de señal intraproteica" . Diario FEBS . 281 (14): 3218–3227. doi : 10.1111 / febs.12855 . PMID 24863503 .
Libros científicos
- Gibbons, NE (1974). "Familia V. Halobacteriaceae fam. Nov.". En RE Buchanan; NE Gibbons (eds.). Manual de Bergey de bacteriología determinante (8ª ed.). Baltimore: Williams & Wilkins Co. ISBN 978-0-683-01117-3.
Bases de datos científicas
- Referencias de PubMed para Natronomonas
- Referencias de PubMed Central para Natronomonas
- Referencias de Google Scholar para Natronomonas
enlaces externos
- Página de taxonomía del NCBI para Natronomonas
- Búsqueda de páginas de taxonomía del Árbol de la vida para Natronomonas
- Búsqueda de la página Species2000 para Natronomonas
- Página de MicrobeWiki para Natronomonas
- Página LPSN para Natronomonas
- Tipo de cepa de Natronomonas pharaonis en Bac Dive - la base de metadatos de diversidad bacteriana