Lista de modelos de simulación COVID-19 - List of COVID-19 simulation models
Los modelos de simulación de COVID-19 son modelos matemáticos de enfermedades infecciosas para la propagación de COVID-19 . La lista no debe confundirse con las aplicaciones COVID-19 que se utilizan principalmente para el rastreo de contactos digitales .
Tenga en cuenta que algunas de las aplicaciones enumeradas son modelos o simuladores exclusivos de sitios web , y algunas de ellas se basan en (o utilizan) datos en tiempo real de otras fuentes.
Modelos con el respaldo más científico
La sublista contiene simuladores que se basan en modelos teóricos. Debido a la gran cantidad de investigaciones previas a la impresión creadas e impulsadas por la pandemia de COVID-19, especialmente los modelos más nuevos solo deben considerarse con mayor rigor científico .
Simulaciones y modelos
- Chen y col. simulación basada en el modelo Bats-Hosts-Reservoir-People (BHRP) (simplificado a RP solamente)
- CoSim19 - Prof Lehr, basado en el modelo SEIRD
- MODELADO DE MOVILIDAD COVID-19 - Stanford basado en el modelo SEIR
- Simulador COVID-19 - Harvard Medical School basado en un modelo de dinámica de sistemas (compartimento) validado
- Oleada de COVID-19 - CDC
- COVIDSIM - por Mark Kok Yew Ng et al.
- CovidSim - Imperial College London , Centro MRC para el Análisis Global de Enfermedades Infecciosas , Neil Ferguson et al.
- CovidSim - Proyecto de investigación de la Universidad de Ciencias Aplicadas de Múnich, Prof Köster
- COVIDSim - escrito en MATLAB por Ng y Gui
- CovidSIM.eu - Martin Eichner, Markus Schwehm apoyado por la Universidad de Tübingen y patrocinado por el Ministerio Federal de Educación e Investigación de Alemania .
- CovidSIM - Schneider et al.
- CovRadar: para la vigilancia molecular de la proteína corona pico
- El modelo del Dr. Ghaffarzadegan
- Event Horizon - COVID-19 - HU Berlin basado en el modelo SIR-X
- IA evolutiva: "Intervenciones no farmacéuticas (NPI) que la IA genera para diferentes países y regiones a lo largo del tiempo, su efecto previsto".
- Modelo IHME - Instituto de Métricas y Evaluación de la Salud modelo COVID
- OxCGRT: el rastreador de respuestas gubernamentales COVID-19 de Oxford
- SC-COSMO - Modelo de simulación de coronavirus Stanford-CIDE
- SECIR - Modelo del Centro Helmholtz para la Investigación de Infecciones
- Inversión inteligente de recursos de pruebas de ARN de virus para mejorar la mitigación de Covid-19
- Colección de Epidemiología de SIAM
- Modelo COVID de Youyang Gu
Bases de datos del genoma
Varios de estos modelos utilizan bases de datos del genoma, incluidos los siguientes:
- Banco de datos de ADN de Japón
- Archivo europeo de nucleótidos
- GISAID
- Asignación filogenética de linajes de brotes globales nombrados
Consorcios, agrupaciones de investigación, otras colecciones
- Lista de los CDC de suposiciones e inclusión de pronósticos: lista grande con diferentes modelos, etc.
- CORSMA - Consorcio de la UE (COVID-19-Outbreak Response que combina e-health, serolomics, modelización, inteligencia artificial e investigación de implementación)
- COVID-19 Forecast Hub: actúa como un depósito central de pronósticos y predicciones de más de 50 grupos de investigación internacionales.
-
Nextstrain : proyecto de código abierto para aprovechar el potencial científico y de salud pública de los datos del genoma de patógenos
- Consulte también los recursos de Nextstrain SARS-CoV-2
- SIMID - Modelos de simulación de enfermedades infecciosas - Consorcio de investigación de Bélgica
- RAMP - Asistencia rápida para modelar la pandemia (Reino Unido)
- Consorcio de modelado UT Austin COVID-19
- Enfoques computacionales para fomentar la innovación en el tratamiento y diagnóstico de enfermedades infecciosas por fronteras
Monitores, modelos o cuadros de mando de vacunación
Nota: Los siguientes recursos (adicionales) se basan principalmente en datos reales, no en simulación. Pueden incluir características predictivas, por ejemplo, estimación de la tasa de vacunación, pero en general no se basan en fundamentos teóricos o de modelos como la lista principal de este artículo. No obstante, la previsión sigue siendo importante. (Ver por ejemplo: El Centro de Pronósticos COVID-19 )
- Tablero COVID-19 - Centro de Ciencia e Ingeniería de Sistemas (CSSE) en la Universidad Johns Hopkins (JHU)
- COVIDVaxView por el CDC
- Datahub Novel Coronavirus 2019 dataset - COVID-19 dataset Coronavirus disease 2019 (COVID-19) series de tiempo que enumeran casos confirmados, muertes reportadas y recuperaciones reportadas.
- Impfdashboard.de - el monitor de vacunación de Alemania
- Simulation der COVID19-Impfkampagne - Monitor para la campaña de vacunación en Alemania por Zi Data Science Lab
-
Proyecciones COVID-19 del Instituto de Métricas y Evaluación de la Salud (IHME)
- Véase también el modelo COVID del Instituto de Métricas y Evaluación de la Salud
Modelos con menos respaldo científico
Los siguientes modelos son únicamente para fines educativos.
- Modelo de Autómatas de Defensa Celular
- Simulador Covid-19
- COVID19: Top 7 - Una lista seleccionada publicada en Medium
- github.com/topics: covid-19
- Simulador COVID-19 de ISEE Systems
- nCoV2019.live - "Los números que necesita de un vistazo rápido" por Schiffmann / Conlon
- cov19.cc- por Conlon
- Simul8 - Recursos de simulación COVID-19
- Simulando coronavirus con el modelo SIR
- Simulación de propagación de virus
- ( Sociedad Química Estadounidense ) CAS COVID-19 BIOINDICATOR EXPLORER
- Rastreador de datos COVID de los CDC
- Socios de la sociedad civil en solidaridad contra COVID-19 (CSPAC): Informe de estado de COVID-19 completo, en vivo, global para 251 locales y 71 barcos
- Cornell Institute for Social & Economic Research (CISER): Fuentes de datos COVID-19
- Modelado multifásico euleriano-lagrangiano , por ejemplo, para la transmisión de COVID-19 en ascensores basado en CFD
- Inicio de los síntomas de la simulación de COVID-19 (Modelo de progresión estocástica) por Larsen et al.
- Datos de origen del coronavirus de Our World in Data
- Proyecto de seguimiento COVID 19 del Atlántico
- Vadere - Marco de código abierto para simulación de peatones y multitudes
- Panel de control de coronavirus (COVID-19) de la OMS
Capacitaciones y otros recursos
- Especialización en modelado de enfermedades infecciosas : proporcionada en Coursera por el Imperial College de Londres
- Presentamos el kit de herramientas de aprendizaje automático y simulador de COVID-19 para predecir la propagación de COVID-19 - Blog de aprendizaje automático de AWS
Ver también
- Modelo SIR
- Simulación por ordenador
- Modelado matemático de enfermedades infecciosas
- Biología Computacional
- Bioinformática
Referencias
Otras lecturas
- Adam D (abril de 2020). "Informe especial: Las simulaciones que impulsan la respuesta mundial al COVID-19". Naturaleza . 580 (7803): 316–318. doi : 10.1038 / d41586-020-01003-6 . PMID 32242115 . S2CID 214771531 .
- Alper J. "Guía de aprendizaje de modelado covid WXML 2020" . Departamento de Matemáticas . Seattle, Washington: Universidad de Washington.
- Fuller J (marzo de 2021). "¿Qué son los modelos de modelos COVID-19 (filosóficamente hablando)?" . Historia y Filosofía de las Ciencias de la Vida . 43 (2): 47. doi : 10.1007 / s40656-021-00407-5 . PMC 7994354 . PMID 33770267 .
- Prabha S, Karthikeyan P, Kamalanand K, Selvaganesan N (julio de 2021). Prabha S, Karthikeyan P, Kamalanand K, Selvaganesan N (eds.). Modelado e imágenes computacionales para SARS-CoV-2 y COVID-19 (1 ed.). Boca Ratón: CRC Press. doi : 10.1201 / 9781003142584 . ISBN 978-1-003-14258-4.
- Roberts M, Driggs D, Selby I, Sala E, Schönlieb CB (1 de junio de 2021). "Luchando contra una pandemia con imágenes médicas y aprendizaje automático: lecciones aprendidas de COVID-19" . Noticias SIAM .