FC Van fue fundado el 31 de mayo de 2019 en la ciudad de Charentsavan , provincia de Kotayk, por el empresario armenio-ruso Oleg Ghukasov. El club participará en la temporada 2019-20 de la Primera Liga de Armenia .
El 30 de julio de 2020, se anunció que Van había otorgado una licencia para competir en la Premier League armenia para la temporada 2020-21 . El 31 de julio de 2020, la vicepresidenta Karen Barseghyan anunció que dejaría el cargo de entrenador en jefe para concentrarse en ser vicepresidente, y que Sevada Arzumanyan fue nombrado nuevo entrenador en jefe del club. El 2 de febrero de 2021, Van anunció que Konstantin Zaytsev había reemplazado a Sevada Arzumanyan como su entrenador en jefe.
Nota: Las banderas indican la selección nacional según se define en las reglas de elegibilidad de la FIFA . Los jugadores pueden tener más de una nacionalidad ajena a la FIFA.