Enterobacterales - Enterobacterales

Enterobacterales
Citrobacter freundii.jpg
Citrobacter freundii , un miembro de la orden
clasificación cientifica mi
Dominio: Bacterias
Filo: Proteobacterias
Clase: Gammaproteobacteria
Pedido: Enterobacterales
Adeolu et al., 2016
Familias
Sinónimos
  • Enterobacteriales

Los enterobacterales son un orden de bacterias gramnegativas , no formadoras de esporas, facultativamente anaerobias , con forma de bastoncillo de la clase Gammaproteobacteria . El género tipo de este orden es Enterobacter .

El nombre Enterobacterales se deriva del término latino Enterobacter , refiriéndose al género tipo de la orden y el sufijo "-ales", una terminación usada para denotar una orden. Juntos, Enterobacterales se refiere a un orden cuyo tipo de nomenclatura es el género Enterobacter .

Identificación histórica y sistemática

Enterobacterales se propuso en 2005 con el nombre de "Enterobacteriales". Sin embargo, el nombre "Enterobacteriales" no fue validado según las reglas del Código Internacional de Nomenclatura de Procariotas , por lo que carecía de posición en la nomenclatura, por lo que el nombre se escribió entre paréntesis. "Enterobacteriales" era un orden monotípico , que contenía sólo la familia Enterobacteriaceae , y compartía su género tipo Escherichia . La orden contenía un grupo grande y diverso de especies, que ocupaban nichos ecológicos distintos y poseían una variedad de características bioquímicas. Muchos géneros dentro del orden tiene un impacto significativo en la actividad humana, tales como las especies patógenas de Escherichia coli , Salmonella enterica , y Yersinia pestis , así como la agricultura-daño fitopatógenos tales como miembros de los géneros Dickeya , Pectobacterium , Brenneria , Erwinia y Pantoea . La gran cantidad de especies, así como la variedad de diferentes características bioquímicas, hicieron que la descripción del orden y sus subgrupos fuera extremadamente difícil. La asignación y clasificación de este orden se basó en gran medida en las secuencias del genoma del ARNr 16S, que se sabe que tiene un bajo poder discriminatorio y produce resultados diferentes según el algoritmo y la cepa de organismo utilizados. Además, estos análisis han demostrado que 'Enterobacteriales' exhibió ramificación polifilética, con distintos subgrupos.

En 2016, se propuso la reclasificación de "Enterobacteriales" como Enterobacterales, y el género tipo cambió a Enterobacter de acuerdo con el Código Internacional de Nomenclatura de Procariotas. Además, se propusieron varias familias nuevas dentro del orden Enterobacterales, que consisten en especies que anteriormente eran miembros de la familia Enterobacteriaceae en base a agrupaciones encontradas en árboles filogenéticos construidos a partir de genomas conservados, secuencias de rRNA 16S y análisis de secuencias multilocus así como independientes marcadores moleculares ( indeles de firma conservados ).

A partir de 2021, el orden Enterobacterales contiene 7 familias publicadas válidamente ( Budviciaceae , Enterobacteriaceae , Erwiniaceae , Hafniaceae , Morganellaceae , Pectobacteriaceae y Yersiniaceae ).

Firmas moleculares

Los análisis de las secuencias del genoma de las especies de Enterobacterales identificaron cinco indeles de firma conservados (CSI) para este orden en las proteínas, el péptido, el transportador ABC, la permeasa, la proteína similar al factor P de elongación YeiP, la L-arabinosa isomerasa , la pirofosfatasa y una proteína hipotética, que en la mayoría de los casos son compartidos exclusivamente por todos o la mayoría de los miembros de esta orden. Estos CSI proporcionan un medio molecular para demarcar este orden de otras Gammaproteobacteria y respaldan la naturaleza monofilética del orden Enterobacterales.

Genera

Filogenia de Enterobacterales

Pasteurellales ( grupo externo )

Enterobacteriales

Budviciaceae

Morganellaceae

Hafniaceae

Yersiniaceae

Pectobacterias

Erwiniaceae

Enterobacterias

Filogenia de los Enterobacterales propuesta en 2016. Pasteurellales se utiliza como grupo externo.

Géneros publicados válidamente

Los siguientes géneros han sido publicados válidamente, por lo que tienen "Standing in Nomenclature". El año en que se propuso el género aparece entre paréntesis después del nombre del género.

Géneros Candidatus

Propuestos, pero no han obtenido una posición en la nomenclatura.

  • Aquamonas (2009)
  • Aranicola (1997)
  • Atlantibacter (2016)
  • Averyella (2005)
  • Grimontella (2003)
  • Guhaiyinggella (1995)
  • Margalefia (2004)
  • Tiedjeia (2005)

Referencias