B elemento de reconocimiento - B recognition element
El elemento de reconocimiento B ( BRE ) es una secuencia de ADN que se encuentra en la región promotora de la mayoría de los genes en eucariotas y arqueas . El BRE es un elemento regulador en cis que se encuentra inmediatamente cerca de la caja TATA y consta de 7 nucleótidos . Hay dos conjuntos de BRE: uno (BREu) que se encuentra inmediatamente aguas arriba de la caja TATA, con el consenso SSRCGCC; el otro (BREd) encontró alrededor de 7 nucleótidos corriente abajo, con el consenso RTDKKKK.
El BREu fue descubierto en 1998 por Richard Ebright y sus colaboradores. El BREd fue nombrado en 2005 por Deng y Roberts; tal reconocimiento aguas abajo se informó a principios de 2000 en la estructura cristalina de Tsai y Sigler.
Vinculante
El factor de transcripción II B (TFIIB) reconoce BRE y se une a él. Ambos BRE funcionan junto con la caja TATA (y la proteína de unión a la caja TATA ) y tienen varios efectos sobre los niveles de transcripción.
TFIIB utiliza repeticiones similares a ciclina para reconocer el ADN. Las hélices alfa C-terminales de TFIIB se intercalan con el surco principal del ADN en el BREu. Las hélices N-terminales se unen al surco menor en BREd. TFIIB es una parte del complejo de preiniciación que ayuda a que la ARN polimerasa II se una al ADN.
Además de la estructura de TFIIB-BRE humana, se han resuelto estructuras de muchos otros organismos. Entre ellos se encuentran el factor de transcripción B (TFB) del arqueón Pyrococcus woesei que presenta una orientación invertida y un TFIIB del parásito Trypanosoma brucei que a pesar de algunas inserciones específicas muestran un pliegue similar.
Ver también
- Caja CAAT
- Potenciador (genética)
- Elemento iniciador
- Aislante (genética)
- Promotor (biología)
- Sitio de inicio de transcripción
Notas
Referencias
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